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二穗短柄草(brachypodium distachyon)与小麦、大麦和燕麦等同属于早熟禾亚科,因其具有生长周期短,基因组小等特点被认定为新型模式植物,可促进禾谷类粮食作物的结构和功能基因组学研究。MADS-box基因家族参与调节植物的许多重要生长发育过程,如花器官的形成,春化作用,营养器官的发生,种子发育及抗逆反应等。本研究以短柄草基因组中已鉴定的MADS-box基因为研究对象,对该基因家族的保守基序、系统发育和进化选择压力等进行了初步分析,并对可能参与抗逆反应的6个基因的表达特性进行了研究,为深入研究禾谷类作物的MADS基因家族的结构、功能和表达调控等提供参考数据。本研究所得的主要结果如下：1、通过相似序列的数据库搜索,鉴定了两条MADS-box家族的新候选基因。2、分析了57个MADS-box家族成员的保守基序,发现了基序1 (MADS domain)是该家族的保守基序,基序K-box具有基因亚类特异性,基序N-terminal和基序Coiled coil region+unknown没有基因亚类特性。3、对水稻和短柄草的MADS-box基因进行了系统发育分析,并将57条短柄草基因进行了分类,分别有37条、7条、6条、4条、3条基因属于MIKCC、MIKC*、Ma、Mβ和Mγ5个亚家族,并鉴定了24对直系同源基因。4、染色体定位分析发现1-5号染色体上分别有19、13、14、8和5条MADS-box基因。基因的碱基替换率分析发现大多数Ⅰ型基因在进化中所受到的选择压力较弱,大部分Ⅱ型基因所受到的选择压力较强,基因较保守。5、6条可能参与抗逆反应基因的表达特性分析发现,他们的表达具有不同的组织和发育阶段特异性,并参与了不同的非生物胁迫反应,与其在水稻和拟南芥中的直系同源基因的表达特性相似。