乳腺癌中基因间长片段非编码RNA的表达及鉴定

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乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,是一类多因素高度异质性的肿瘤,其组织学的形态多种多样,因此能够准确的评估其临床病理特征,对早期的诊断、采取有效的治疗方法以及预后分析具有重要的意义。目前虽然对肿瘤发生发展的分子机制的研究不断深入和乳腺肿瘤的诊断和治疗手段的不断进展,但乳腺癌仍然是死亡率最高的女性恶性肿瘤。LincRNA在乳腺肿瘤的发生发展过程中呈现不同的表达水平,对乳腺肿瘤筛查和诊断具有潜在的指示作用。本文共采用了 25例从浙江省肿瘤医院收集的病理信息完善的乳腺癌及对应的癌旁组织。首先通过5例有明确病理信息,手术前未经过任何化疗、放疗和内分泌治疗的乳腺癌组织及对应的癌旁组织进行多样本混合,构建ployA-minus ncRNA文库,采用Hi-seq 2000多末端测序的方法进行高通量测序。通过对高通量测序所得的数据进行分析处理,筛选差异表达的lincRNA。利用软件预测所筛选的部分lincRNA进行二级结构的预测。通过荧光定量技术分析目标lincRNA在20例乳腺癌及对应癌旁组织中的差异表达情况,结合临床病理指标包括年龄、激素受体水平、淋巴结转移情况、HER2和p53的表达进行分析其相关性。通过研究发现,通过高通量测序,共获得156条在乳腺癌及对应癌旁组织中差异表达的lincRNA,通过对其二级结构及表达稳定性分析,筛选了四条差异表达的lincRNA进行深度的分析。所筛选的四条lincRNA在乳腺癌及对应癌旁组织中稳定存在并表达;lincRNA-BC2和lincRNA-BC5且在乳腺癌和对应的癌旁组织中显著高表达,而lincRNA-BC4和lincRNA-BC8显著低表达,均已达到极显著水平(P<0.01)。此外在结合病理信息分析,lincRNA-BC5在Ⅲ期、孕激素阴性、以及高年龄组(>54岁)乳腺癌患者中显著高表达;lincRNA-BC4在Ⅲ期乳腺癌患者中显著低表达;lincRNA-BC8在p53阴性乳腺癌患者中显著低表达,lincRNA-BC2是与各指标的没有统计学上的相关性的独立分子。以上结果显示差异表达的lincRNA可以用于区分癌与癌旁组织,在临床诊断中具有参考意义。在病理指标的相关性可在对肿瘤的诊断、治疗方法的采用和预后等方面具有潜在的应用意义。
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