黄瓜果皮黄棕色性状的遗传分析与定位研究

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黄瓜(Cucumis sativus L.)是我国广泛栽培的主要蔬菜作物之一,其营养丰富,深受消费者喜爱。果皮颜色是黄瓜重要的品质性状,开展黄瓜果皮颜色性状的研究对指导黄瓜品质育种具有重要意义。本研究选用成熟果皮呈现黄棕色的黄瓜自交系PW和成熟果皮呈现绿色的黄瓜自交系Gy2为亲本,构建四世代遗传群体(P1、P2、F1、F2),对控制黄瓜成熟果果皮颜色yellow-brown(yb)基因进行遗传分析和基因定位研究。主要研究结果如下:1.通过对PW与Gy2的四世代群体进行田间表型统计,并对黄瓜成熟果果皮颜色进行遗传分析,结果发现,F1植株成熟果皮全部为黄棕色,F2植株成熟果黄棕色果皮和绿色果皮的植株分离比经卡平方检测符合3:1,由此推断黄瓜成熟果黄棕色果皮性状是由一对基因控制的质量性状,且成熟果皮黄棕色对绿色为显性。2.使用极端单株混池(BSA)结合高通量测序技术(Mutmap),将yb基因初步定位于4号染色体0~4.12 Mb区间范围内。进一步利用PW与Gy2构建的239株F2代作图群体绘制分子标记遗传图谱,将yb基因定位于InDel166394至SSR22231的区间内(Chr4:166,394~1,065,156)。3.根据初步定位结果,进一步通过重组株筛选及在区间内加密标记,最终将yb基因精细定位至~17kb(Chr4:499,872~516,951)的区间范围内,两侧翼标记为SNP499872和SNP516951,使用FGENESH软件预测到3个候选基因,且均编码环氧化物水解酶。4.将3个候选基因在亲本间进行基因克隆及序列比对发现:CsGy4G000840基因在Gy2材料中存在一个单碱基突变,突变位点在亲本Gy2第二个内含子末端,从而导致基因剪切发生了变化,其余两个基因序列完全一致。对黄瓜果实不同发育期CsGy4G000840基因的表达量进行分析,结果表明该基因在两亲本间的表达量存在显著差异,果实发育第24 d该基因在PW果皮中表达量显著高于Gy2中。5.根据CsGy4G000840在双亲中的碱基位点,开发了一个CAPS标记(SNP01),并在黄瓜自然群体中验证,结果表明,该SNP位点的基因型与成熟果皮颜色间的吻合度高达86.8%,可以用于标记辅助选择。
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