巴西橡胶树遗传图谱15个标记的物理定位

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本研究利用荧光原位杂交技术对Lespinasse等构建的巴西橡胶树遗传图谱中2个连锁群上15个标记位点进行了物理定位,并将这些标记位点所在的连锁群与橡胶树核型图进行了整合。这不仅可为构建橡胶树分子细胞遗传图谱奠定基础,还可为橡胶树分子辅助育种、种质资源鉴定、比较基因组学等研究提供有力的科学依据。本研究所得的具体结果如下:(1)对Lespinasse等构建的巴西橡胶树遗传图谱15个RFLP标记位点设计了特异引物。其中2号连锁群为6个标记位点,分别为ghbCIR 540、ghbCIR229、ghbCIR327、ghbCIR580、ghbCIR282和ghbCIR393,3号连锁群为9个标记位点,分别为gHbCIR 148、gHbCIR 319、gHbCIR 359、gHbCIR 439、gHbCIR 478、gHbCIR 497、gHbCIR 524、gHbCIR536和gHbCIR659。共设计40对引物,经筛选后得到15对特异性引物,即每个标记位点筛选出1对特异引物。这15对特异引物对巴西橡胶树热研7-33-97的基因组DNA进行PCR扩增,都分别能扩增出一条清晰的单一条带,且大小均在800bp-1400bp之间,对单一条带进行回收、测序和比对,比对结果显示PCR扩增的序列均为目的序列。(2)对2号连锁群上的6个标记的PCR胶回收产物进行荧光标记制备探针,然后进行荧光原位杂交检测与核型分析,结果显示这6个遗传标记位于巴西橡胶树热研7-33-97 品种的第 6 号染色体上,其中 gHbCIR229、gHbCIR282、gHbCIR393 和gHbCIR 580均位于长臂上,信号点到着丝粒的百分距离分别为41.46、48.48、45.65和51.02;gHbCIR540和gHbCIR327位于短臂上,信号点到着丝粒的百分距分别为61.90和20.0。2号连锁群上所选取的6个标记位点都定位到了巴西橡胶树热研7-33-97品种的第6号染色体上,表明由Lespinasse等构建的巴西橡胶树遗传图谱2号连锁群与第6号染色体对应。(3)对3号连锁群上的9个标记的PCR胶产物进行荧光标记制备探针,通过荧光原位杂交检测与核型分析,实验表明gHbCIR148、gHbCIR359、gHbCIR439和gHbCIR 659均位于巴西橡胶树热研7-33-97品种的第7号染色体的长臂上,信号点到着丝粒距离分别为 78.26、60.78、58.18 和 20.59;gHbCIR319、gHbCIR478、gHbCIR 497、gHbCIR524和gHbCIR536均位于第7号染色体的短臂上,信号点到着丝粒的距离分别为8.33、26.09、45.45、52.94和10.71。3号连锁群上的9个标记均被定位到巴西橡胶树第7号染色上,说明Lespinasse等所发表的3号连锁群与橡胶树的7号染色体成对应关系。
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