【摘 要】
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鸫属是雀形目鸟类中最大的属之一,且分布范围广泛。但是鸫属属内种间的分子系统发育研究目前仍不明确。本文对白颈鸫、灰头鸫以及棕背黑头鸫的线粒体基因组全序列进行了测定,
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鸫属是雀形目鸟类中最大的属之一,且分布范围广泛。但是鸫属属内种间的分子系统发育研究目前仍不明确。本文对白颈鸫、灰头鸫以及棕背黑头鸫的线粒体基因组全序列进行了测定,并对三种鸟类的基因排布进行了定位。同时与从GeneBank下载的斑鸫、灰背鸫、乌鸫、旅鸫、欧歌鸫、棕腹鸫的线粒体基因全序列进行了比较。结果表明,九种鸫属鸟线粒体基因组结构全部为双链闭合环状DNA分子,除欧歌鸫外,其他八种鸫属鸟编码37个基因和一个非编码区,欧歌鸫存在基因组增大现象,含有40个编码基因和两个非编码区。以九种鸫属鸟全序列做贝叶斯和最大似然数分析,结果表明基于这两种方法构建的系统发生树拓扑结构是一致的:1、在九种鸫属鸟中,欧歌鸫处于树的基部,是相对其他八种鸫属鸟最早分化出来的物种;2、旅鸫和棕腹鸫聚为一个亚枝互为姊妹种;3、灰头鸫与白颈鸫互为姊妹种而后与斑鸫、棕背黑头鸫及灰背鸫聚为一枝;4、乌鸫的系统发生地位在两种系统发生树中有差异。以白颈鸫、灰头鸫以及棕背黑头鸫和自GeneBank上下载其他56种鸫属鸟类的12S rRNA和Cytb基因的串联序列做贝叶斯和最大似然数分析,结果表明:1、相对其它八种鸫属鸟欧歌鸫仍然处于根部;2、旅鸫与乌鸲鸫互为姊妹种;3、灰背鸫与乌灰鸫互为姊妹种而后与黑胸鸫和蒂氏鸫聚为一枝;4、斑鸫与赤颈鸫互为姊妹种,而后与环颈鸫聚为一枝;5、灰头鸫与白颈鸫互为姊妹种;6、棕背黑头鸫与白头鸫在一个支系,关系较近;7、棕腹鸫与褐背鸫互为姊妹种;8、乌鸫位置在两树之间存在差异仍不能确定,有待进一步研究。对鸫属九种鸟类的16个基因(包括13个PCGS,2个rRNA基因合一个D-loop区)单基因的可靠性进行分析,结果表明:16S rRNA和ND4两个基因在鸫属鸟系统发生树构建中可靠性较高。为了更精确的理解鸫属鸟之间的分类和系统发生关系,之后的研究中仍需增加样本的数量与序列的长度,并且要注意方法的标准化。
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