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在网络时代，B2B电子商务已经逐渐成为促进经济增长的新亮点和未来商务的发展趋势，然而，中国B2B市场进展缓慢，造成这种状况的原因是多方面的，尤其是B2B电子商务组织之间跨越多个企业建立和应用企业间信息系统，在他们之间有大量的协调工作，而目前学术界缺乏相关研究。为此，本项目利用Multi-Agent对B2B电子商务的结构进行分析与界定，然后对B2B电子商务组织间协调控制的影响因素进行分析，在此基础上对B2B电子商务组织间协调控制度进行评估，并对B2B电子商务组之间协调控制的主要影响因素进行抽取，同时构建B2B电子商务组之间协调控制理论模型，最后对本研究进行总结。
本研究的创新与发展主要表现在电子商务理论方面，尤其是中国背景下的B2B电子商务理论，具体如下：
(1)弥补了电子商务理论中对B2B电子商务中组织之间协调控制影响因素的识别研究的不足。本文对B2B电子商务中组织之间协调控制不同层面影响因素进行研究，最终获取B2B电子商务中组织之间协调控制影响因素，弥补了电子商务理论中对B2B电子商务中组织之间协调控制影响因素识别研究的不足。
(2)弥补电子商务理论中对B2B电子商务中组织之间协调控制评估的不足。目前，学术界缺乏针对B2B电子商务中组织之间协调控制评估问题的研究，本项目在分析B2B电子商务中组织之间协调控制评估特点的基础上提出了运用贝叶斯属性模型和模糊数学综合评价等方法来实现对B2B电子商务中组织之间协调控制评估，从而有效弥补现有电子商务理论中对B2B电子商务中组织之间协调控制评估的不足。
(3)弥补电子商务理论中对B2B电子商务中组织之间协调控制主要影响因素获取不足。B2B电子商务中组织之间协调控制主要影响因素有哪些，不同类型的B2B电子商务中组织之间协调控制主要影响因素是不一样的，本项目提出了B2B电子商务中组织之间协调控制主要影响因素的获取方式有效地解决了这个问题。
(4)弥补电子商务理论中对B2B电子商务中组织之间协调控制理论模型构建的不足。目前，理论界对于如何解决B2B电子商务中组织之间协调控制的理论模型还很少有构建，本研究根据B2B电子商务中组织之间协调控制的特点，提出了运用基于案例推理和模拟退火算法的方式来构建B2B电子商务中组织之间协调控制理论模型，这就有效解决了现有研究的不足。