裂腹鱼亚科（Schizothoracinae）鱼类隶属于硬骨鱼纲（Osteichthyes）鲤形目（Cypriniformes）鲤科（Cyprinidae）,是分布于青藏高原及其周边水域中的特有鱼类,在新疆主要分布于塔里木河流域及伊犁河流域,是重要的环境生态指标生物。裂腹鱼类的生存环境较为特殊,形态鉴定尤为困难,因此其分类一直存有争议;另外,有关新疆裂腹鱼类单殖吸虫病原的研究较少。本研究采集了5种裂腹鱼类及其寄生的指环虫,结合形态学和分子生物学方法对鱼类及其指环虫进行了种类鉴定和系统发育分析,统计裂腹鱼类上指环虫的感染情况,分析其空间分布特点,探索指环虫与宿主间协同进化关系等工作。研究结果为新疆裂腹鱼类的物种保护和指环虫病的防控提供了基础资料,丰富了我国指环虫名录,同时也为指环虫与宿主间协同进化关系的研究提供科学依据。结果如下:（1）对采自叶尔羌河流域的5种裂腹鱼的COⅠ、16S rRNA及ND 4基因序列进行了扩增和进化关系的分析。5种裂腹鱼3种基因的序列相似度分别为97.3%、98.8%、95.4%;3种基因的A+T含量明显高于G+C的含量,表现出明显的反G偏倚;转换颠换比均大于2。遗传距离结果显示,个别物种的种间遗传距离小于种内遗传距离,说明裂腹鱼种间可能存在杂交导致基因渗透。多基因联合构建BI树和ML树均显示,除叶须鱼属,其它属的裂腹鱼亚科鱼类以原始、特化和高度特化的分类标准对应三个类群,其中裂腹鱼属位于系统发育树基部,是较原始的类群。（2）对寄生于叶尔羌河斑重唇鱼和四种裂腹鱼属鱼类鳃部的指环虫,进行了特征性结构的描述、绘制及测量,同时与国内外已记述斑重唇鱼和裂腹鱼鳃上寄生的几种指环虫进行形态比较。结果显示,采集的两种虫体在形态上,分别与前苏联文献记载的单式指环虫（Dactylogyrus simplex）和利式指环虫（D.linstowi）的结构基本一致,且测量值无显著差异。因此,采集的指环虫分别鉴定为单式指环虫和利氏指环虫,两者均为我国指环虫属的新记录种。基于18S-ITS1-5.8S rDNA序列构建的系统发育树显示单式指环虫与鲫属鱼类的指环虫亲缘关系较近,利式指环虫与鲃属鱼类上寄生的指环虫聚为一支。（3）对斑重唇鱼鳃部寄生单式指环虫的感染情况及空间分布特点进行分析。结果显示,在检查的325尾斑重唇鱼中,共检出3994只单式指环虫,总感染率和平均感染丰度分别为67.7%和12.3±1.2;左鳃及右鳃的感染率分别为59.4%和57.2%,两者之间的感染丰度无显著差异（P>0.05）;在各鳃片中,鳃Ⅰ、鳃Ⅱ的平均感染丰度显著高于鳃Ⅳ（P<0.01）;单式指环虫在宿主各体长组间的感染丰度没有显著差异（P>0.05）。结果表明,单式指环虫对宿主左右鳃和年龄的大小没有选择偏好性,但在鳃片上更偏好寄生于鳃Ⅰ和鳃Ⅱ。单式指环虫在宿主种群中的分布类型为聚集分布。（4）对利氏指环虫在不同宿主上的感染情况和空间分布特点进行了统计分析。结果显示,利式指环虫在四种裂腹鱼上的感染率均在50%以上,但平均感染强度和丰度较低,在4.6～6.9和3.2～4.6之间;利式指环虫在各宿主左右鳃及各鳃片上的感染丰度差异性均不显著（P>0.05）;除重唇裂腹鱼外,利氏指环虫随着其它裂腹鱼体长的增加,其感染参数随之增高,在S>18 cm体长组时达到最大,且平均感染丰度显著高于其它体长组（P<0.05）。结果表明,利式指环虫在各宿主鳃上的寄生没有选择偏好性,但对较大宿主更具有寄生偏好性。利式指环虫在各裂腹鱼鳃部的分布类型均为聚集分布。（5）利用18S-ITS1-5.8S rDNA和Cyt b基因序列分别构建指环虫和宿主鱼类的系统发育树,分析两者间的进化关系。结果显示,大多数指环虫能够在进化关系上与宿主相互对应,在亚科水平上存在一定的协同进化关系,并且这些指环虫的物种形成主要是采取共物种形成的模式,但裂腹鱼亚科与其指环虫在进化关系上与宿主未完全对应,我们认为与指环虫的物种形成有关。