自2003年起，我国开始在全国范围内推行新型农村合作医疗制度（以下简称“新农合”）。但对于异地就诊的情况，大多数地方的新农合虽然原则上允许异地就医，但各级医院的报销水平和范围存在地区差异，异地就医的医疗费用往往显著高于户籍所在地，并且报销手续较为复杂。因此，新农合实际上对医疗保险的参加与赔付施加了地域限制。本文研究了新农合对农民工就业选择的影响。本文首先在托达罗模型的分析框架中引入新农合制度，以探讨其对农民工在就业地点选择的影响；然后利用CHIP2008农村数据，使用二元和多元有序logit模型分别检验新农合对农民工流动就业所产生的“枷锁效应”（即新农合是否会使农民工更倾向于在本县就业）和“拉回效应”（即新农合是否会增强在外务工农民工的返乡意愿）。研究结果显示，新农合具有一定的“枷锁效应”，但并不显著；而参加新农合明显增强了农民工的返乡意愿，具备显著的“拉回效应”，特别是对于健康状况欠佳的农民工来说，新农合的实施使他们更加愿意留在县内工作。因此，我国应当逐步破除医疗保障制度的地域分割性，保障农民工的基本社会福利，有助于改善其生活和就医条件，促使其自由流动。