ADH7基因座表达的调控序列及相关SNPs与精神分裂症的关联及法医学意义研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:turandeji
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目的:精神分裂症是较严重的精神疾病,在某些刑事案件中常涉及到精神分裂症的鉴别问题。由于其临床诊断缺乏客观指标,给相应的司法鉴定造成困惑。该病病因尚不清楚,但遗传因素是重要的病因已成共识,如多巴胺能、5-羟色胺能学说等,对中枢神经功能有作用的基因都有可能参与了精神分裂症的发生,因此被认为是多基因疾病。ADH7基因编码IV类乙醇脱氢酶,将视黄醇氧化为视黄醛,进而参与维甲酸的产生,并影响维甲酸的代谢途径和代谢过程。而维甲酸信号通路的改变可能与严重精神障碍的发病机制有关,如精神分裂症、抑郁症和阿尔茨海默病等。关于ADH7基因及相关SNP是否与精神分裂症相关还未见报道。本研究将以中国北方汉族人群为样品,探讨ADH7基因5’及3’端特定DNA片段中的SNPs和不同单倍型的分布及与精神分裂症是否相关,并探讨各单倍型与特定DNA片段不同长度截断体对基因表达的影响,以分析基因表达的调控序列,为进一步研究ADH7基因的功能提供工作基础。研究方法:收集中国北方汉族健康无关个体313例及精神分裂症患者275例外周血样品,酚氯仿法提取基因组DNA后采用PCR技术扩增ADH7基因的5’端-693 bp~+110 bp、3’端-153 bp~+1029 bp及+765 bp~+1162 bp 3条DNA片段,5’端产物使用Sanger序列分析法,3’端产物使用Sanger序列分析法和RFLP检测技术对样品中的SNPs进行分型。对获得的SNPs数据应用Haploview4.2软件进行Hardy-Weinberg平衡检验及连锁不平衡分析,应用Power Stats V1.2计算个人识别能力、杂合度、多态性信息含量、非父排除概率等法医学参数。对健康对照组与疾病组进行组间的基因型与等位基因和单倍型差异进行卡方检验和关联性分析。应用基因克隆技术将各单倍型及5’端和3’端产物的不同截断体连接表达载体,采用双荧光素酶报告检测技术测定各单倍型及不同截断体在HEK-293、U87和SH-SY5Y等3种细胞中的相对荧光强度。分别使用JASPAR、Animal TFDB3.0软件和Target Scan Human7.2数据库预测5’端转录因子的结合位点和3’端mi RNAs的结合位点。结果:本研究共检测到rs2654847、rs2851028、rs17537595、rs4147554、rs284786、rs3805331、rs894369、rs3805329、rs284787和rs729147等10个SNPs位点,并获得了其多态性群体数据。10个SNPs基因型频率分布符合HardyWeinberg平衡(P>0.05),其中rs2851028、rs284786、rs894369、rs284787和rs729147等5个SNPs位点多态性分布较好,DP值均大于0.5。全部SNPs的等位基因、基因型及单倍型分析均未发现在健康与疾病群体间存在有统计学意义的差异。在ADH7基因5’端,含有FH1的重组子表达的相对荧光强度在HEK-293、U87和SH-SY5Y三种细胞系中,均明显高于FH2、FH3和FH4;含有-1369 bp~-1625 bp区域的截断体重组子表达的相对荧光强度明显增强,而含有-768 bp~-987 bp和-1203 bp~-1369 bp区域的截断体重组子表达的相对荧光强度则明显减弱。在ADH7基因3’端,含有H2的重组子表达的相对荧光强度在U87和SHSY5Y细胞系中最高,与H1和H3的差异显著;在U87细胞系中,H2与H4相对荧光强度相比也具有显著差异;在HEK-293细胞系中,H1相对荧光强度最高,与H2相比有明显差异。含有+468 bp~+564 bp区域的截断体重组子在三种细胞中表达的相对荧光强度均降低。含有+258 bp~+380 bp区域的截断体重组子在HEK-293和SH-SY5Y细胞中表达的相对荧光强度也降低。结论:1.在中国北方汉族群体中,ADH7基因的rs2851028、rs284786、rs894369、rs284787和rs7291475等5个SNPs位点具有较好的遗传多态性,可用于法医学个人识别和亲权鉴定检验实践。未发现ADH7基因10个SNPs及单倍型的分布与精神分裂症相关。2.ADH7基因rs2654847和rs2851028在基因表达的调控中可能起重要作用。5’端的-1369 bp~-1625 bp、-768bp~-987 bp和-1203bp~-1369 bp区域可能含有可以调控ADH7基因表达的功能序列。3.ADH7基因3’端的+258 bp~+380 bp和+468 bp~+564 bp区域可能含有可以调控ADH7基因表达的功能序列。
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