基因组序列中启动子区域的预测方法研究

来源 :中国科学技术大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wuyongliang0907
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文介绍了基因预测及启动子区域预测的研究现状,总结了常用的特征和方法;同时结合翻译始点等新特征,设计了一个新颖的预测算法来预测启动子区域。 本文的主要工作和特色如下:将全长cDNA序列与基因组序列作比对,获得启动子区域和辅助功能点的数据集用于训练。使用在基因预测上具有良好效果的判别分析方法,训练时获得各特殊功能点的判别函数,在预测时综合使用各判别函数进行预测。根据启动子区域是否与CpG岛相关,选用不同特征分别进行训练,这将提高与CpG岛相关的启动子区域的预测效率。对于第一外显子中包含翻译始点的情况,算法使用了翻译始点附近的寡聚物频率、翻译始点与转录始点的距离等特征。   
其他文献
现代计算机技术极大地促进了计算科学的发展。在实践中,由于受到物理器件极限速度和技术水平的限制,使得单处理机远远满足不了现代许多领域中具有挑战性的大规模计算课题对计
自然语言处理是语言学、逻辑学、生理学、心理学、计算机科学和数学等相关学科发展和结合而形成的一门交叉学科。自然语言处理的目标就是让计算机能够处理人类语言,并作出人
随着网络技术和信息技术的发展,电子商务已逐步被人们所接受,然而,基于开放性的Internet上的电子商务虽然具有传统商务所没有的优势,但同时也必须面对一些新问题的挑战。开放性的
本文首先阐述了面部关键特征点的自动定位在人脸自动识别系统中的重要作用,简要介绍了国内外研究现状,分析探讨了几种重要的定位方法.然后在第二章详细介绍了主动形状的弹性
由于IP地址的枯竭,及IPv4本身的一些安全设计缺陷,从IPv4向IPv6的升级是不可避免而且是迫在眉睫的。IPv6除了继承了IPv4的一些特性外,还增加了许多新特性,如“无限”的地址空
随着人们生活水平的不断提高和社会经济的不断发展以及社会对交通运输需求的不断增加,智能交通监控设备得到了广泛应用。目标检测及跟踪是智能交通监控系统实现的关键,也是场景
本文提出了一个完整的车牌照识别方法。主要内容包括综述了国内外流行的车辆牌照识别技术,分别介绍了车辆牌照系统的每一个组成部分和国内外的识别方法。采用了基于灰度图
磁盘数据的存取和传输到内存的速度一直是计算机系统的性能瓶颈。虽然现在磁盘转速和总线速度已经有了很大提高,但磁盘容量的大幅度增大又减缓了对其上数据的存取速度。数据
本文首先给出了视频压缩编码所采用的基本框架.然后专注于运动估计模块,对当前存在的采用块匹配的多种快速运动估计算法进行了整理分类.并从中选择了四步法(4SS)、动态搜索窗
计算机应用技术已经从最早的科学计算发展到现在的多学科、多领域的交叉集成,并推动了新兴学科——虚拟现实技术的不断发展。其中,虚拟人动画技术已经成为虚拟现实技术中最重要