中国农村税费改革是自2000年从安徽开始试点的，旨在探索建立规范的农村税费制度和从根本上减轻农民负担的办法。实施四年多来，目前已取得了阶段性成效，基本实现“减轻、规范、稳定”的预期目标。农田水利基本建设是农业和农村经济发展的重要基础，其投入主体是农民，受益主体也是农民。实行税费改革，将“取消统一规定的劳动积累工和义务工”，“村内进行农田水利基本建设、修建村级道路、植树造林等集体公益事业所需劳力，实行一事一议，由村民大会民主讨论决定”，“村内用工实行上限控制”等。这是农村制度的一项重大改革。根据制度经济学派的观点，这不仅会引起农民与国家的分配关系的变化，还将引起产权关系、意识形态诸方面的变化。如对农田水利基本建设来说，这些政策规定，不可避免地给农田水利基本建设带来影响和新的挑战。农田水利基本建设的组织方式、投入渠道和投入机制都发生了深刻变化，实践中出现了新的矛盾。本文在分析这些新变化和新矛盾的基础上，提出了在当前农村税费改革新形势下，搞好农田水利建设的工作思路、对策和方法等。