应用ABEEMσπ/MM方法探究天门冬氨酸二肽和三肽的稳定构象

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本论文主要从以下两个方面进行论述。第一方面:本文应用Gaussian09程序包对天门冬氨酸二肽、三肽分子的骨架二面角进行扫描,以寻找最适合的方法基组与扫描步长,从而得到天门冬氨酸的稳定构象。对天门冬氨酸在气相与液相下带电的与电中性的天门冬氨酸二肽分子分别进行扫描,探究环境对天门冬氨酸二肽分子稳定构象的影响,发现在扫描得到的构象中稳定的是在分子内构成了氢键。为了进一步证实这个结论,本文对同为酸性氨基酸的谷氨酸二肽的骨架二面角进行扫描,同样发现了最稳定构象中形成的氢键。第二方面:应用ABEEMσπ/MM
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