战略性新兴产业已成为我国实现国家创新驱动和经济方式转变的关键举措，科技型中小企业作为高新技术的载体，其创业是否成功直接影响整个产业发展，间接影响整个区域发展。孵化器作为培育科技型中小企业的组织，其对在孵企业的发展起到非常重要的作用。现有关于孵化器研究的文章集中在服务评价与在孵企业成长绩效的方面，对孵化器影响在孵企业的创新活动研究没有统一的结论；另外从组织间关系角度看，组织之间的关系对组织双方的知识共享等活动产生影响，进而对组织的技术创新活动产生影响。孵化器管理团队与在孵企业间关系可能成为在孵企业发展的影响因素之一，但目前的研究较少涉及这一方面，对于实践指导工作也有限。本文首先对孵化器与在孵企业发展现状、组织间关系理论发展现状进行回顾，梳理相关研究成果，并提炼可借鉴经验和研究不足。其次，本文从孵化器与在孵企业共同生产理论、组织间关系理论两方面进行分析，对孵化器管理团队与在孵企业间关系划分为信任、信息交流和互惠承诺三个维度，并据此提出孵化器管理团队与在孵企业间关系对技术创新绩效影响的模型。然后，选取具有代表性的样本进行实证分析，为以上的假设提出相应的实践依据。最后，通过理论分析和实证分析，本文得出以下结论：第一、孵化器管理团队与在孵企业间关系的三个维度之间相关性较高。尤其是信任与信息交流、信任与互惠承诺之间的相关性较高，双方之间的相互信任是建立其他关系的基础。第二、孵化器管理团队与在孵企业间关系与技术创新绩效呈正向关系，孵化器管理团队与在孵企业应共同加强关系的投入与建设，对企业的成长才会具有显著的推动作用。