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[目的]
用阳性血清筛选华支睾吸虫成虫cDNA表达文库,以其筛选到新的序列,研究其功能,希望成为新的诊断抗原基因为华支睾吸虫的诊断制剂的研发、抗华支睾吸虫病药物的新靶药点的发现甚至为候选疫苗的研制提供重要的研究基础。
[方法]
1.华支睾吸虫成虫cDNA文库的免疫学筛选:
免疫筛选血清的收集;抗血清预吸收;宿主菌的制备;cDNA文库的免疫学筛选;定位并挑取其中的2个阳性克隆。
2.2个新序列的扩增、测序和克隆:
2个阳性克隆PCR鉴定;PCR产物的纯化回收;纯化的DNA片段与克隆载体连接并转化;质粒的提取和双酶切;测序;设计引物、2个新序列的PCR、克隆与质粒的提取、酶切;新基因序列的片段与表达载体的连接和转化。
3.对筛选到的新序列进行生物信息学分析:
使用DNA star软件中的Editseq程序进行一级结构的分析,包括开放阅读框、氨基酸组成、蛋白质相对分子质量、理论等电点等;使用在线HNN软件进行二级结构的分析,包括α-螺旋、β-转角、无规卷曲等;使用Expasy软件对拓扑结构和跨膜螺旋的预测;使用BLASTx程序进行基因的比对和同源性分析;使用Expasy软件中的NetPhos程序进行特定位点分析;使用SignaIP软件进行信号肽序列分析;使用IEDB AnalysisRecource在线分析工具进行抗原表位和亲水性分析;使用rpsblast对结构域分析等等。
[结果]
对华支睾吸虫成虫cDNA文库进行免疫学筛选,筛选到了12个阳性克隆,对其中的2个阳性克隆进行了亚克隆,预测了其片段长度。2个阳性克隆序列编码蛋白分别与CD63抗原和Lumenin蛋白保护信使同源性最高,生物信息学分析得出2个编码蛋白均是膜蛋白,可能的亚细胞定位在内质网腔中,都有潜在的B细胞抗原表位、信号肽和跨膜螺旋等等。
[结论]
华支睾吸虫成虫cDNA文库的筛选,找到了有潜在免疫学价值的诊断抗原基因,并初步预测了其编码蛋白的结构和功能。