荔枝特异性测试已知品种数据库的构建

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荔枝(Litchi chinensis Sonn.)为无患子科(Sapindaceae),荔枝属(Litchi)。常绿乔木,原产于中国。中国荔枝的栽培面积和品种类型均位于世界首位,是我国重要的热带亚热带果树资源,有“岭南果王”之称。为使荔枝DUS测试过程中近似品种筛选更加准确高效,本研究依据农业行业标准NY/T 2564-2014《植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南荔枝》对74个荔枝品种的42个基本性状进行了观测,并通过SSR分子标记对74个荔枝品种的基因型进行了分析,主要研究结果如下:1.对74个荔枝品种的42个测试性状中的质量性状和假质量性状直接赋予代码;对其中叶片长度、叶片宽度、节间长度、叶轴长度、叶柄长度、枝条粗度、花穗长度、花穗宽度和果实可食率等9个数量性状进行测量、记录原始数据并进行了分级范围划分:叶片长度、节间长度、叶轴长度、枝条粗度、花穗长度、花穗宽度和果实可食率等7个数量性状符合正态分布或近似正态分布,采用最小显著差法进行了分级范围划分;叶片宽度和叶柄长度不符合正态分布,按照级差法确定了分级范围。2.对荔枝的每一测试性状各表达状态间的差异进行了GAIA权重赋值,并得到部分荔枝品种间表型GAIA距离。聚类分析结果表明,在GAIA距离为12处可将42份品种划分为3大类,在GAIA距离为10时,可划分为6个类群。3.挑选6个表型差异较大的参试品种从129对SSR引物中筛选出多态性较高的引物20对;利用20对SSR引物对74个荔枝品种进行PCR扩增和毛细管电泳分析,结果共扩增出84条条带,其中多态性条带80条,多态性条带率达到96.43%,每对引物检测出2~7个条带,平均每条引物扩增出条带4.2个;UPGMA方法聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.71处,可将74个荔枝品种划分为4个主要类别;STRUCTURE群体遗传结构分析同样也将所有供试品种划分为4类,并表明每个群体内存在广泛的基因交流。4.在20对多态性高的引物中,仅用LZ63、LZ20、LZ11、LZ17、LZ74和LZ42等6对引物即可将74个荔枝品种完全区分;以这6对引物为核心引物构建了74个荔枝品种的DNA分子指纹图谱,形成了各品种特有的“分子身份证”。5.分子距离和表型GAIA距离的相关性达到极显著相关水平,在遗传相似系数为0.89和表型GAIA距离阈值为5时,分子和表型联合使用可有效提升DUS测试近似品种筛选的准确性。6.对测试指南中部分错误作出指正;部分性状表达状态提出重新划分建议。
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