目前,在种子保存方面,采取低温保存技术是植物种质长期保存较为理想的保存方法。汉麻种子低温保存的系统研究在国内外仍处于空白。因此本试验旨在通过探索低温保存条件下汉麻种子的生理学、代谢组学调控模式,汉麻幼苗时期出苗率、株高、叶绿素含量及相关土壤养分含量在研究及完善种子低温保存技术的基础上,揭示种子耐低温调控分子机理和重要调控物质,为有效延长种子寿命和保持种子活力提供技术和理论参考。本研究共设定对照CK1（常温保存1a）、CK2（常温保存2a）、A（4℃保存1a）、B（4℃保存2a）、C（-20℃保存1a）、D（-20℃保存2a）6个处理。测定不同处理汉麻种子时期,发芽率、抗氧化酶活性、丙二醛含量、糖代谢相关酶指标,幼苗时期的出苗率、株高、叶绿素含量,并通过非靶向代谢组学探究种子耐低温调控分子机理和重要调控物质。1.低温保存条件提高了汉麻种子的发芽率、发芽势、发芽指数。-20℃条件下保存1a或2a的汉麻种子发芽指数呈上升趋势。2.低温保存条件提高了汉麻种子抗氧化酶活性。过氧化氢酶（CAT）、超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化物酶（POD）C处理较CK1分别提高了34.74%、199.90%、473.84%。-20℃保存1a丙二醛（MDA）、脯氨酸（PRO）含量较常温降低了44.94%、32.13%。3.汉麻种子在不同低温保存条件下,C处理较CK1蔗糖合成酶（合成方向:SS-Ⅱ）活性、蔗糖磷酸合成酶（SPS）活性、蔗糖含量、葡萄糖含量呈上升趋势分别提高了133.32%、427.03%、65.12%、72.66%。蔗糖合成酶（分解方向:SS-Ⅰ）活性则降低了83.07%。4.利用非靶向代谢组学发现处理A蔗糖含量显著下调,与生理指标检测结果一致。关键代谢物主要参与的代谢途径有苯丙氨酸,酪氨酸和色氨酸的生物合成、色氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、异喹啉生物碱的生物合成、苯丙烷生物合成、乙醛酸和二羧酸的代谢。且汉麻种子在低温条件保存1a或2a中,-20℃条件下差异代谢物变化较稳定。5.汉麻种子在-20℃保存1a条件下出苗率、幼苗株高、叶绿素含量均高于常温保存。综上所述,汉麻种子在低温保存条件下,发芽率、及幼苗出苗率、株高、叶绿素含量较常温有所提高。并通过提高抗氧化酶活性,降低丙二醛和脯氨酸含量及促进蔗糖代谢保持种子活力,因此低温条件有利于保存汉麻种子,且-20℃保存1a汉麻保持较高的种子活力。在播种时能有效降低播种量和减少成本。