基于DNA链置换的分子识别电路的设计及应用

来源 :施倍宇 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuyibi1987
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
1946年第一台具有高速计算能力的计算机诞生后,随着现代科技日新月异的进步,硅基计算机已经逐渐达到了摩尔定律的发展极限,因此寻找一种新型计算方式是时代进步所需。DNA是一种被认为在分子水平上具有可计算性的纳米分子。精准的WatsonCrick碱基互补配对原则让DNA作为新型计算机材料成为可能。DNA链置换技术的可控性及其出色的计算能力使其在DNA计算领域得到广泛的应用。为了丰富DNA计算的信息处理方式,本文提出了一种基于DNA链置换技术的分子识别电路,并在此基础上设计实现了分子比较器,用于构建一位和多位的可逆数值比较器。主要研究内容如下:首先,基于跷跷板门电路构建了DNA分子识别电路,该电路由分子识别、累加求和、荧光报告结果三个模块组成。通过Visual DSD仿真以及生化实验分析,验证了该识别电路在逻辑上的可行性和稳定性,其最大的优势在于荧光报告过程不需要进行分子湮灭反应,而是直接进行荧光报告。相比于传统的分子电路,该设计减少了DNA链、减少了泄漏、降低了复杂性。分子识别电路具有任意输入的计算潜能。其次,基于DNA分子识别电路结合了交叉抑制器,设计实现了分子比较器,这是一个模块化功能电路,为DNA计算的研究提供了基础。通过Visual DSD仿真证明了该设计的逻辑可行性,还通过荧光报告实验进一步验证。该设计通过简单的级联反应可以实现信号的比较功能。最后,在实现分子比较器的基础上,构建了一位和多位的可逆数值比较器,其为生物传感器中的定量分析任务提供一种设计思路。相较传统计算机的不可逆运算,本文提出了一种可逆运算,通过设计可逆分子门电路,使输入信号充分反应,减少了运算过程信息丢失的情况。本文逻辑设计通过Visual DSD仿真,并对一位,二位和四位可逆数值比较器进行了模拟实验,其结果都符合了预设计的结果,进一步验证了该设计的逻辑严谨性。综上,本文通过了DNA链置换技术,开发了DNA分子识别电路;基于分子识别电路,结合交叉抑制器设计了分子比较器;构建了一位和多位的可逆数值比较器;最后通过荧光报告实验呈现,证明了理论设计的分子比较器的准确性以及可行性,还通过Visual DSD模拟实验验证了可逆数值比较器的准确性。本文开发的分子识别电路具有任意输入的计算潜能,为今后大规模多输入的DNA分子电路提供了基础。模块化功能的分子比较器电路可进行级联反应后实现其他功能,为DNA计算的研究提供了基础。
其他文献
随着企业股权激励形式的多样化,股权激励对企业经营绩效等方面的作用日益凸显。本文分别从市值管理、财务绩效、创新绩效、环保绩效等角度梳理股权激励与企业绩效之间的关系,针对现有研究的不足,提出未来研究方向。
期刊
肠套叠主要是指两条肠管互锁的现象,在小儿外科比较常见,我国儿童肠套叠的平均发病率远高于全球。肠套叠对儿童的身体健康危害非常大,早期及时诊断并积极正确治疗,可预防肠坏死,减轻儿童疼痛,如不及时治疗,套叠处肠管可能因为肠壁长时间受压导致血液循环障碍而发生肠坏死、肠穿孔,病情严重的患儿甚至会死亡。超声作为一种无创、无痛的检查方法,很容易被儿童及其家人所接受,因此超声诊断儿童肠套叠有明显的优势。目前人工智
学位
急速发展的互联网和信息技术使我们进入了一个信息爆炸且超负荷的大数据时代。为了解决这个问题,推荐系统随之产生,并取得了飞快的发展。中国在线音乐市场规模近几年扩张十分迅速,庞大的音乐推荐需求促进了个性化音乐推荐系统的发展,不断改进推荐算法来提升个性化推荐效果已变得越来越重要。传统推荐算法始终存在着一些局限性,比如个性化推荐问题等。由于单一推荐模型的推荐效果更容易产生局限性,因此尝试将不同的模型进行混合
学位
胸片是诊断儿童肺部疾病的主要依据之一。然而,受儿童肺部发育不完善、可接受X光辐射剂量低等因素的影响,儿童胸片的图像质量通常得不到很好的保证,使得医生对儿童胸片的解读较为困难。尤其在部分医疗资源匮乏地区,由于有经验的放射科医生数量稀少,普遍存在医生工作量大,诊断能力不足的现象,导致胸片的解读效率低下,漏诊、误诊现象频出。随着人们对儿童健康关注度的逐年增加,对疾病的早期化预防及针对性筛查意识不断加强,
学位
如今,随着信息技术广泛应用于各行各业,大数据也发挥着越来越重要的作用,在企业经营、政策制定等诸多方面产生了举足轻重的影响。通过快速获取、处理、分析和提取海量多样化、有价值的交易数据、交互数据,大数据最终可以针对现有的运作模式提出优化方案。因此,作者选择了《大数据科学与分析:实践方法》一书来做翻译实践,对大数据做一些概括性的介绍。本书的第一章重点介绍了何为大数据、大数据的工作原理及大数据的应用领域,
学位
随着大数据时代的来临,人们对计算的需求不断增长,然而,半导体的制造技术可能在未来十年内达到极限,这为研究人员寻找新的计算方法和计算媒介提供了动力。DNA分子是一种天然的计算媒介,高度并行的计算能力、可编程性以及极高的存储密度使其成为计算研究领域的研究热点。作为DNA计算中最重要的技术之一,DNA链置换技术将DNA计算的发展推向了一个新的高度,它利用DNA碱基互补配对规则实现信息传递和操作。已经有许
学位
随着经济全球化的深入发展,贸易便利化逐渐受到越来越多国际组织和政府的关注。经过多方多轮谈判,全球贸易便利化发展取得了一定的进展,但是不同国家的贸易便利化水平仍然参差不齐,这对包括中国在内的各国开展对外贸易带来了一定的阻碍和挑战。近几年贸易保护主义有所抬头,中美贸易摩擦持续,受制于美国及其盟友国的政治和经济打压,中国的制造业出口受到严重的冲击。制造业作为中国经济的支柱性产业,需要寻求新的外部发展机遇
学位
医学图像分割与检测定位是医学图像处理及分析领域的重要研究内容,同时也是对医学成像数据中感兴趣区域进行二次提取的关键技术。在自动化处理过程中涉及到分割和椎体的定位标号工作,可以极大地减少医务工作者重复且乏味的数据信息筛选过程,辅助医生完成病灶分析与定位,便于及时制定后续的治疗方案。由于人体的解剖结构具有一定的复杂性,同时医学成像设备种类繁多,在数据在成像过程中也易受外界环境的干扰。相对于自然图像而言
学位
代工企业在我国经济发展中扮演着重要的角色,积极承担全球价值链(GVC)的分工,促使中国成为世界第一大制造国。近年来,随着人口红利的消退,代工环节长期处于“微利化”与“被俘获”的境地;新冠疫情的全球爆发,更是给代工企业的供应链稳健性带来极大挑战。代工企业面临着前所未有的发展困局,亟需通过转型与升级摆脱现状。数字技术的普及与数字经济的发展为中国代工企业实现技术与市场突围、摆脱低端锁定与战略俘获提供了绝
学位
SysML2对SysML v1.x做了多个方面的改进,其中非常引人注目的一个改进是提高了语言的精确性和表达能力,支持了文本代码表示。但是编程本身是一个难度较高的活动,而且纯文本编程方式作为当前主流的编程方式,其语法晦涩难懂而且编写时常伴随着大量的指令混淆和语法错误,常常使初学者望而却步。因此,对于如何降低使用者使用SysML2进行建模的设计难度,很有研究意义。目前,不断涌现的创新高级语言都将可视化
学位