水下文化遗产因其很高的商业、历史、文化、科研等价值吸引人们争相探索,在这个过程中,水下文化遗产也遭受到严重破坏。虽然已经有国际公约和一些国内立法通过规定管辖权对其进行保护,但在水下文化遗产管辖权真正行使过程中,管辖权行使的冲突问题和商业开发管制困难问题比较严重,阻碍了对水下文化遗产的保护。本篇论文通过对管辖权冲突问题和对商业开发管制困难的问题进一步分析,总结出问题存在的原因,以“21世纪海上丝绸之路”的提出、水下文化遗产博物馆、数字图书馆效果的显现以及我国正在修改的相关立法为背景,并结合最佳实践和可持续发展等保护理念,尝试提出了完善《水遗公约》、促进签订双边、多边或区域协定以及构建数字生态保护区和博物馆等对策,来解决管辖权冲突问题和商业开发管制困难问题。并且分析了我国行使水下文化遗产管辖权过程中存在的问题及原因,通过借鉴国际公约的规定、英法等国比较优秀的立法及实践,提出了完善正在修订的立法以及加强与其他国家的合作等对策来应对我国的管辖权问题。