水利是农业的命脉，十六大以来，我们国家就非常重视农业水利建设，投入了大量的资金用于农业水利设施的建设和改善，十年来也取得了举世瞩目的成绩，但是由于一些地方政府比较多的从自身利益出发，置水利设施建设客观需求不顾，盲目抢项目，争投资，致使水利投资效率下降，造成了国家和地方财力的损失和浪费。因此研究农业水利的投资效率对我国的农业发展具有十分重要的现实意义。党的十八大报告强调，必须把强化农业水利作为发展现代农业、提高农业综合生产能力的首要条件和战略举措，大兴农业水利建设，从根本上夯实国家粮食安全基础。这一大政方针的提出表明，提高农业水利的供给效率，增加粮食产量，已经成为我国未来农业经济社会发展的核心工作之一。因此，对农业水利问题进行研究，建构与完善农业水利的供给体制，具有重要的理论和现实意义。本文采用2001—2010年我国农业水利投入和产出的面板数据，通过非参数的DEA方法和两阶段相关联DEA方法，对我国农业水利投资的效率进行实证研究，发现我国“十五”期间农业水利相对有效的地方几乎都集中在西部地区的，这跟我们国家实施的西部大开发战略密不可分。“十一五”期间达到有效的地区从西部地区拓展到了中部和东部地区。最后在前两个模型分析的基础上，通过运用DEA的基于非参数Malmquist指数方法来观察我国“十一五”期间农业水利投资效率对其产出指标在时间序列上的动态影响，发现中部和西部大多数省份效率低下的原因是缺乏先进的生产技术，缺少技术创新。针对存在的问题，从技术，政策，以及监督机制层面上提出了改进的建议。