茎瘤固氮根瘤菌ORS571二鸟苷酸环化酶基因功能的研究

来源 :山西农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:zjzhanjx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
茎瘤固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans)菌株ORS571可与宿主植物毛萼田菁(Sesbania rostrata)共生形成根瘤或茎瘤而共生固氮,也可在自生状态下固氮生存。环二鸟苷酸(cyclic diguanylate or cyclic di-guanosine monophosphate,c-di-GMP)作为细菌中普遍存在的第二信使,在细胞信号转导中起到十分重要的作用。c-di-GMP能够调节各种生理功能的前提是二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)能接受到来自感应结构域如PAS、GAF、REC等的信号的传递,从而启动或关闭相关基因的转录和翻译,调节细胞内c-di-GMP水平的变化。本文应用生物信息学工具分析编码二鸟苷酸环化酶(DGC)的基因,从中选择5个含有不同感应结构域的环化酶基因(包括AZC-2411、AZC-2412、AZC-2512、AZC-3566和AZC-3914)进行深入研究,以期解析c-di-GMP在A.caulinodans strain ORS571中的调控作用,主要研究内容和结果如下:(1)生物信息学分析显示,5个候选DGC蛋白都具有GGDEF结构域,推测5个候选DGC蛋白可能具有催化生成c-di-GMP的二鸟苷酸环化酶活性。采用基于cre-loxp重组酶系统的根瘤菌基因敲除体系和采用三亲接合技术,成功地构建了这5个候选DGC蛋白各自的基因敲除突变株,即ΔAZC-2411、ΔAZC-2412、ΔAZC-2512、ΔAZC-3566和ΔAZC-3914。(2)为阐明所选基因的功能,本文对上述突变株的表型进行鉴定。在液体培养基中测试生长状况,绘制各突变株的生长曲线。利用液相色谱串联质谱法测定各突变株体内c-di-GMP含量。在L3半固体平板上检测趋化能力,观察各突变株趋化圈的大小。在有氧条件下进行絮凝实验,测定各突变株的絮凝量。利用结晶紫染色法测定生物膜,观察各突变株的生物膜产量变化。利用蒽酮-浓硫酸氧化法测定胞外多糖产量,检测各突变株胞外多糖生产水平。通过进行竞争性结瘤实验,探究各突变株与宿主植物互作能力。实验结果表明,5个突变株的生长与野生型几乎无差异。与野生型相比,除3株突变体(AZC-2411,AZC-3566和AZC-3914)无显著差异外,突变株ΔAZC-2412和ΔAZC-2512的c-di-GMP含量、絮凝量和胞外多糖产量均减低,然而趋化能力增强。此外,无论是在L3-N或L3+N培养基中,突变株ΔAZC-2412和ΔAZC-2512形成的生物膜量均低于野生型。竞争结瘤实验显示,突变株ΔAZC-2412和ΔAZC-2512的结瘤能力亦显著降低。研究表明环二鸟苷酸合成酶基因AZC-2412和AZC-2512均能通过控制c-di-GMP水平,进而调控A.caulinodans菌株ORS571的生理生化(胞外多糖、细菌运动、生物膜和细胞絮凝)及与宿主植物互作(结瘤固氮)等生物学特性。这些发现为全面解析细菌第二信使c-di-GMP介导的调控机制提供了新知识,也为优异固氮菌株A.caulinodans ORS571的应用提供了科学参考。
其他文献
降水是全球水循环的关键环节,连接着大气过程和地表过程,在物质和能量循环中扮演重要角色。精确的降水信息及其时空分布对水文学、气象学、气候学和农业科学等研究领域具有重
蔬菜黄萎病是大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)引起的土传维管束真菌病害。该菌遗传变异快、寄主广、难防治。真菌细胞骨架在胞质分裂、菌丝形态建成、菌丝顶端生长及定殖宿主
在石油钻井,修井过程中,上、卸钻杆的速度和效率是影响钻井完成速度的重要因素。传统的作为连接钻杆或立根的重要工具的液压大钳已经很难满足实际工作需求,而且存在许多安全
关节臂式坐标测量机是一种以角度测量为基准的非正交系精密仪器,具有操作简单、重量轻、灵活性强、适用场景广泛、测量空间大等特点,主要应用于模具设计、夹具定位检测、产品质量控制、逆向工程等领域,具有广泛的应用前景。目前关节臂式坐标测量机的主要问题是测量精度较低,影响其测量精度的因素可分为动态和静态两大类。静态因素主要是指测量机的结构参数误差,例如连杆长度误差、关节长度误差等,一般通过运动学标定来解决。动
随着社交媒体以及各大社交平台的进一步发展,信息大爆炸的现代社会的快速来临,各种良莠不齐的短文本数据充斥在我们的身边,如微博数据、各大评论状态信息、影评等信息,这些短文本数据信息中绝大多数都蕴藏着丰富且高价值的信息。目前经常被使用到的方法是主题模型,该类模型主要是通过建模学习文档数据集中潜藏的主题结构以便自动去理解分析文本集内的语义。传统主题模型基本上都是基于长文本数据进行建模学习,在应用到短文本上
夏布是一种历史悠久的手工织麻布,属于传统纺织品。受到纺织技艺、原料、工具的限制,手工织麻布一直是我国古代人民的常用面料,而制作精细的夏布更是一度成为皇室贡品。随着时代的变迁,传统手工纺织品离人们的生活越来越远。近些年人们开始对传统文化给予更多地关注,作为传统手工织造品的之一的夏布及其背后所蕴含的历史文化逐渐受到了人们的重视。位于重庆西部的荣昌是全国闻名的夏布产地之一,其产出的夏布细密平整,莹洁润滑
融资融券交易,是两种证券市场的信用交易手段,即向证券公司拆借资金进行融资交易与向证券公司拆借证券进行融券卖空交易的合称。2010年3月31日,融资融券交易于我国沪深两市正
锂离子电池的高比能量、高工作电压、循环寿命较长、安全性能好,较小的自放电率、和环境友好等优点,已被广泛用作便携式电子设备和电动汽车的能源。负极材料是锂离子电池的关键材料之一,而石墨材料是目前商业化最成熟的锂离子电池负极材料,比如人造石墨和天然石墨等,但是这些材料面临着可逆容量低的问题,严重限制了锂离子电池在电动汽车等领域的应用。天然微晶石墨的晶粒直径小于1μm,石墨化度在95%左右,晶粒之间分布着
建筑用户在室行为是影响建筑能耗的关键因素之一,对其进行准确预测有助于建筑系统运行优化控制和建筑性能评估。本文首先对现有建筑用户在室行为测量方法及预测模型进行了回顾,并对不同预测模型的优缺点进行了总结和比较。现有在室行为预测方法主要在测量室内环境参数的基础上,采用传统机器学习的方法对在室行为进行预测。该类方法可自动从数据中挖掘环境参数与在室行为之间的关联,但其难以从环境参数中提取出反映在室行为变化的
气液两相段塞流广泛存在于石油与化工工业中,由于其流动的间歇性和相分布的复杂性,目前对其研究仍处于探索阶段,对其流动机理研究尚缺乏。为高效实现对段塞流流动机理及流动