目的:通过网络药理学分析王垂杰教授治疗功能性消化不良（FD）潜在新方潜在机制,为后续的动物实验研究提供方向、理论依据,为临床治疗提供理论依据,以及建立起传统医学与现代医学理论联系。方法:首先收集王垂杰教授门诊治疗功能性消化不良病历,并用中医传承辅助系统的方剂分析功能分析出潜在新方。用TCMSP数据库找出新方的化合物成分,并以口服生物利用度（OB）≥30%,类药性（DL）≥0.18为标准筛选出有效活性物。并利用TCMSP数据库找出这些有效活性物的作用靶点和基因信息,再通过Uniprot数据库将其标准化。以“Functional dyspepsia”为关键词,在Gene Cards数据库,NCBI库因数据库,以及OMIM数据库,进行人类基因检索,得到FD的靶点。将筛选出的新方靶点与疾病靶点输入韦恩图制作软件Venny 2.1,得到将新方与疾病交集靶点的韦恩图;再将二者共有靶点输入String数据库进行PPI网络的构建,将生物种类设定为“Homo sapiens”,可信度大于0.7,获得到PPI网络。再利用Cystoscape 3.8.0软件中的富集分析功能对新方疾病交集靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析得到新方治疗FD可能参与的生物过程与信息通路,将PPI网络导入Cystoscape 3.8.0中,以纳入的成分、作用靶点、涉及通路为基础,利用cytoscape 3.8.0软件进行成分-靶点-通路网络图的绘制;最后利用cyto Hubba插件,应用Maximal Clique Centrality（MCC）方法,综合11个拓扑分析方法和6个中心性方法,筛选关键靶点、成分、通路,从而分析出新方治疗FD的潜在机制。结果:1.新方由柴胡、栀子、党参、黄连、黄芪五味药组成,主要以槲皮素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇、谷甾醇等活性成分治疗FD,其中槲皮素、木犀草素这两个成分最重要;2.新方治疗FD的潜在靶点主要有AKT1、MAPK1、RELA、IKBKB、MAPK8、CHUK、MAPK10,其中AKT1是最重要的靶点;3.新方潜在靶点具有激酶结合、蛋白激酶结合、蛋白激酶活性等分子功能,参与细胞对含氧化合物的反应、细胞死亡的调控、细胞增殖调节、对刺激反应的负调节等生物过程;4.新方与FD交集靶点涉及的关键通路有肿瘤通路、乙型肝炎、PI3K-Akt信号通路、流体切应力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、癌症中蛋白聚糖、癌症中小分子核糖核酸、HTLV-I感染、甲型流感、、前列腺癌。其中PI3K-Akt信号通路和MAPK信号通路是FD相关最重要的靶点。结论:1.王师治疗FD的潜在新方组成为柴胡、栀子、党参、黄连、黄芩,新方主要通过疏肝理气、祛邪热、补虚来治疗功能性消化不良的肝胃不和证、肝胃郁热证、脾胃虚弱证,或者三者兼夹者;2.新方药理作用是以多有效成分,通过多途径、多环节、多靶点所表现出的综合作用;3.新方中关键的活性成分,在治疗FD方面都涉及了抗抑郁这一方面,由此说明FD的发生与抑郁等精神心理因素相关,推测新方治疗FD可能与其能够抗抑郁有关;4.AKT1是最重要的靶点,与精神分裂和易感病变有关,说明FD的发生与抑郁等精神心理因素和内脏高敏相关,其他靶点多涉及炎症、免疫过程,说明十二指肠低度炎症和免疫参与FD的发生,由此推测新方可能参与调节精神心理因素、内脏高敏相关和十二指肠低度炎症和免疫这些机制发挥治疗FD的作用;5.PI3K-Akt也可能参与了抗抑郁,由此推测新方治疗FD涉及PI3K-Ak信号通路可能也与其有关;PI3K-Akt、MAPK和其他信号通路参与了炎症和免疫,这提示炎症与免疫在FD的发生发展过程中同样扮演具有重要角色,此外新方还可能通过内分泌抵抗通路调节胃肠动力来治FD;6.因新方发挥作用所涉及的重要靶点、信号通路都与抗抑郁有关,所以推测新方治疗因精神心理因素导致的FD或者FD伴有抑郁可能更有效。