区域经济一体化、信息技术的飞速发展以及国家政策的鼓励是中国企业进一步发展的大背景。为了获得更为灵活的当地反应以及突破获取不同地区资源要素的门槛，企业在国内扩张的过程中伴随着企业跨区域分支机构设立数目的不断增长。而在企业区域多元化的过程中，总部应该如何管理和控制处在不同区域的分支机构是必须要考虑的一个战略问题。本文试图整合战略管理理论的资源基础观、市场基础观以及制度基础观的相关研究成果，从合法性视角切入，采取跨案例进行研究，研究影响区域多元化企业对于分支机构管控模式的影响因素，以及这些因素对于管控模式形成的作用机制。通过选取我国广东地区两家具有典型性的制药企业作为案例研究对象，进行探索性案例研究。通过对于现有相关文献的研究，在明确本文的研究问题和重点的同时，构建了管控模式影响机制的初步概念模型，通过对于丽珠集团的案例分析，对概念模型进行完善和理论发展，之后采用逻辑复现的方法对于康美药业的管理实践进行分析，对形成的理论模型进行进一步的验证和完善，在此基础上形成了本文的理论模型。本文研究表明：制度距离、子公司地位与母子公司依存关系等多方面因素的共同作用影响了企业对于分支机构管控模式的选择，企业的合法性倾向成为内外影响因素与管控模式之间关系的中介变量。制度距离与分支机构的外部合法性约束具有正相关关系；子公司的地位、母子公司的依存关系与分支机构的内部合法性约束具有正相关关系，而母公司对外部环境的影响力对外部合法性约束力的大小具有反向调节性作用。企业的内外部合法性约束构成了企业的合法性冲突进而使得企业需要做出合法性倾向的选择。当企业具有外部合法性倾向时，将采用财务管控型的管控模式，而具有内部合法性倾向的企业则更多地采用运营型管控模式，当企业面临的内外合法性处于均衡状态时，企业对于分支机构将采用战略管控型的管控模式。