组学研究的脉络梳理与趋势展望—文献挖掘视角

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:wsadzjh
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目的:随着现代医学的快速发展,人们发现单纯研究某一方向无法解释全部生物医学问题,组学被呈现在公众视野面前。由于疾病种类多,要做到精准医学提倡的精确用药,离不开组学大数据的支持。目前整合多组学的研究工作还很缺乏,尤其是基于不同类型组学数据关联分析的研究。因此准确的把握组学研究的脉络和趋势,有助于科研工作者及时抓住研究热点,调整自己的研究方向。方法:选取PubMed数据库对其1896-2016年收录的所有文献题录信息共计27040819条记录进行下载,利用Python编程语言对具有“组学”含义的单词在每篇文献的题目和摘要中进行标注、统计并分析统计结果。结果:共得到346977条数据,通过年度趋势变化图得到组学文献发表量逐年递增,从2000年后呈井喷式增长;各类单一组学的文献发表量都呈逐年递增的趋势,其中基因组学文献发表量最多,在2014年之前,蛋白质组学文献发表量排第二,2014年之后,转录组学超过了蛋白质组学的文献发表量,成为了继基因组学之后的第二大组学类型;通过主题河图展现了转录组学和线粒体基因组学与基因组学共现的文献量在某一时间节点后呈井喷式增长,其余组学类型与基因组学共现的文献量都呈稳定增长的趋势;通过上下文分析发现与组学类型相关的关键词以其研究技术为主。结论:不同类型组学相继涌现,成为研究热点;由单一组学类型研究向多类型组学融合研究发展;组学研究离不开其研究技术的支持。
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