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目的：唇腭裂是一种常见的出生缺陷，造成患者严重的生理、心理障碍，增加了家庭、社会负担。其发病率存在明显种族差异，在亚洲和北美最高，尤其在中国可高达1．2‰。非综合征型唇腭裂(Nonsyndromic Cleft Lip with or without Palate，NS CL／P)是一种复杂的多基因疾病，遗传因素和环境因素及二者的相互作用都会影响唇腭裂的发病，导致发病率存在明显的种族差异、地域差异甚至家族差异。我国属于高发区，但对唇腭裂所作的基础研究非常有限。因此，针对我国汉族人群进行大样本量的研究就显得尤为重要。为深入了解中国汉族人群高发病率的致病机制，本研究将选取核心家系样本，在已知唇腭裂候选区域内进行精细定位；并筛查已知易感基因干扰素调节因子-6基因(interferon regulatory factor 6，IRF6)中的致病突变在中国汉族NS CL／P人群中的突变情况。这将进一步阐明唇腭裂的发病机理，为将来实施合理的产前干预奠定基础。方法：总结目前为止文献中已报道的NS CL／P的主要候选区域或基因。其中对中国汉族人群的全基因组扫描连锁分析发现，多点HLOD(heterogeneityLOD)最高峰在4q31，并且在对其他民族的连锁分析中也得到支持。该区域已被在线人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man，OMIM)所收录，命名为OFC4(OrafacialCleft 4)。但是，在这个区域内目前尚未鉴定出明确的致病基因。因此，本研究以汉族人群的结果为主要参考，结合其它研究结果，尤其是黄色人种，确定4q31为候选区域进行精细定位。通过TDT-PC(Transmitted Disequilibrium Test Power Calculator)及PGA(Powerfor Genetic Association analyses)软件分别计算核心家系(患儿及其父母，Trios)和病例-对照样本的效力(Power)，发现同等条件下核心家系样本的效力更高。因此，本研究以我国汉族人群NS CL／P核心家系为研究对象。第一阶段，共选取2005年至2008年中国医学科学院整形外科医院唇腭裂中心收集的重度(Ⅱ°、Ⅲ°)NS CL／P核心家系135个，其中24个家系有阳性家族史。签署知情同意后，进行临床资料(包括可疑的环境因素)的收集和外周血样本的采集。用试剂盒法从外周全血中进行DNA的提取，经DNA质量分析后，用于短串联重复序列(ShortTandem Repeat，STR)标记的基因分型。共选取STR标记6个，平均分布于4q31区域。应用PCR技术得到扩增产物片断，采用ABI 3730 DNA全自动测序仪测定PCR产物片段大小。利用GeneMarker软件读取峰图后得到检测片段大小，依此得到每个样本的基因型。对基因型数据校对后进行数据分析。首先，通过Mendel软件计算每个STR位点基因型分布是否符合哈迪-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium)；然后分别应用Mendel软件进行传递不平衡检验(Transmitted Disequilibrium Test，TDT)，应用FBAT软件进行基于家系的关联分析(Family-Based Association Tests)，以发现阳性位点。第二阶段，为进一步验证，又增加核心家系86个(包括Ⅰ°、Ⅱ°、Ⅲ°及分类不明确的NS CL／P)，累计达到221个。在阳性标记周围增加STR标记4个，累计达到10个，基因分型后进行TDT检验。第三阶段，选取核心家系中的177个患者，对已知唇腭裂易感基因IRF6增强子中的单核苷酸多态性(SingleNucleotide Polymorphism，SNP)rs642961(G＞A)进行测序。样本组成为单纯唇裂(Cleft Lip Only，CLO)48个，唇裂伴腭裂(Cleft Lipwith Palate，CLP)67个，分类不明确的62个。经Mendel软件计算，得到致病等位基因A的频率。结果：研究群体9个STR位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡；第一阶段，经Mendel软件分析，STR标记D4S413经TDT检验，结果具有显著性意义(p＜0．05)；经FBAT软件分析，在显性遗传模式下，STR标记D4S413的结果具有显著性意义(p＜0．05)；第二阶段，增加样本及遗传标记数量，STR标记D4S413经TDT检验的结果仍具有显著性意义(p＜0．05)；第三阶段，经Mendel计算，单纯唇裂(CLO)中的致病等位基因A的频率为0．31，唇裂伴腭裂(CLP)中的频率为0．25，群体总的频率为0．28；CLO患者的突变频率要高于CLP，但并无显著性意义。结论：D4S413与中国汉族人群非综合征型唇腭裂的发生相关，附近可能存在NS CL／P的致病基因；中国汉族NS CL／P人群中也存在SNP rs642961(G＞A)突变。