【摘 要】
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本研究应用高通量测序平台Illumina HISEQ 2000对油桐代表性地方品种—泸溪葡萄桐种子发育的三个时期转录组进行测序,经组装分析共获得58439条Unigene,平均长度889nt.其
【机 构】
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中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室 湖南长沙 410004
【出 处】
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中国林学会经济林分会2012年学术年会
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本研究应用高通量测序平台Illumina HISEQ 2000对油桐代表性地方品种—泸溪葡萄桐种子发育的三个时期转录组进行测序,经组装分析共获得58439条Unigene,平均长度889nt.其中有41059条基因可注释到各蛋白数据库,根据COG 库比对结果,可将Unigene按功能分为25 类,其中脂类转运和代谢类有639条；通过与KEGG 数据库比对,对22134条Unigene 进行了Pathway 注释,涉及的Pathway 有128 类,包括生化代谢通路,次生代谢物的生物合成,脂肪酸合成、不饱和脂肪酸的生物合成等代谢途径.基因差异表达分析表明,不同时期样本的基因上调与下调表达均有明显差异.这些分析为油桐重要基因的挖掘及其调控机制、表达模式的研究提供基础数据,为进一步油桐良种选育提供科学依据.
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