利用SSRs和SNPs对我国陆地棉重要经济性状的全基因组关联分析

来源 :中国农学会棉花分会2016年年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:netcapo
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  棉花是世界上重要的纤维作物和油料作物.对棉花重要性状的遗传解析有助于优异等位基因的挖掘、亲本的选配、分子标记辅助选择育种以及多亲本聚合育种.为了更好地解析我国陆地棉优良性状的遗传基础,我们收集了我国自1911年引种至2011年自育的503份陆地棉常规自交种,构建关联分析群体;群体材料包括我国长江流域、黄河流域、西北内陆及北方特早熟棉区的骨干及主栽品种.2012 2013年,调查了503个陆地棉品种在我国三大棉区的4个陆地棉典型生态区域(湖北黄冈、河南原阳、南疆库尔勒和北疆石河子)的纤维品质、产量相关性状、抗病性、种子抗逆萌发率和含油量等性状.同时利用本实验室构建的高密度遗传图谱(5152个标记、全长为4696.03 cM、标记间平均距离为0.91 cM)以及CottonSNP63K array进行全基因的SSRs和SNPs基因型分析,对关联分析群体进行了群体结构和连锁不平衡分析;利用全基因组关联分析方法定位了与这些重要农艺性状关联的标记位点;结合表型和基因型数据鉴定了优异种质资源.
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