传统药物作为人类治疗疾病的主要手段和近200年来高效创新药物开发的重要源泉，已得到世界各国的广泛关注[1]。然而，由于一种药材的药效物质一般并非原药成分，而是在其他药材的作用下，经复杂的酶促合成及体内作用过程而形成的主体特异性成分，其化学组成复杂，各成分间存在相互作用及影响，使得从传统药物中发现活性成分的创新药物研究发展成为一个复杂性科学问题。高通量筛选和高内涵筛选等传统还原论药物活性成分筛选方法近年来在药物开发方面发挥了重要的作用。然而，上述方法在以中药为源泉的创新药物研发方面依然存在筛选准确率低等不足。针对这一问题，本论文将研究的着眼点集中在中药复方中的君-使对药方面，构建了一种基于君-使对药相互作用研究的高效药物研发新策略。该策略包括君-使对药体系的构建、效应成分因果关系辨识数理模型的建立和以受体色谱为核心的药物活性成分筛选及鉴定研究[2]。与传统药物开发方法相比，该策略有望克服药物开发过程中活性成分筛选的盲目性，提高活性成分筛选准确率，从而缩短新药开发周期，不仅能丰富中医药理论，而且能为其他生命科学中的复杂性问题研究提供方法学借鉴。