转Bt基因抗虫棉植株体内能产生杀虫蛋白，对棉铃虫等鳞翅目害虫有较好的抗性，减少了棉田用药量，有利于天敌自然控制作用的发挥。但抗虫棉生产中也存在一些问题，主要表现为品种多、乱、杂，不同品种抗虫性差异大；棉铃虫对转Bt基因抗虫棉也能产生抗性；在蕾期以前抗虫效果好，后期抗虫性下降；转Bt基因棉田棉蚜、棉叶螨、棉盲螬、棉蓟马等害虫种群数量呈上升趋势。提出了转Bt基因棉主要病虫草害综合防治技术。播种期种子药剂处理，防治苗期病害和地下害虫；苗期隐蔽施药防治苗蚜、地下害虫，同时开展化学除草，预防棉花枯、黄萎病；蕾期防治刺吸性害虫、三代棉铃虫、枯黄萎病等；铃期用生物制剂防治四代棉铃虫、甜菜夜蛾及铃病。禁止使用Bt制剂，充分发挥生物生态调控作用，棉铃虫发蛾盛期诱杀成虫，注意科学用药，提高施药质量。