我国犬瘟热病毒H基因的遗传多样性分析

来源 :第十一次全国养犬学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaofeidong
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犬瘟热病毒(CDV)自然感染的宿主已扩大到哺乳纲真兽下纲食肉日所有八个科、偶蹄日猪科和灵长类猕猴属等动物,犬瘟热(CD)的危害日趋严重l真i.犬瘟热的预防免疫还不太理想.Blixenkrone碍口1watsuki.K等[3]相继报道了在欧洲、日本等地先后发生了免疫过的犬爆发犬瘟热感染,Harder等[0]也报道CDV野生型分离物与疫苗株有明显差异,这使人们对日前使川的CD疫曲对流行毒株的有效保护以及CDV保护性抗原基因是否存在/、泛的遗传多样性产生了疑问,为此我们对我国不同地区临床上明显表现为CD的犬病料及我们原先分离的毒株进行了H基因的扩增利全基冈序列测定,并且与GenBank中CDV毒株进行了H基因的遗传多样性分析,本文对其进行了报告.
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采用微卫星标记方法,对中国西部宁夏固原鸡、西藏藏鸡、陕西省的略阳鸡、太白鸡、陕北鸡和南方海南文昌鸡共6个品种,560个个体19个微卫星位点的遗传结构和品种间血缘关系进行了分析研究.结果表明中国地方品种均具有丰富的遗传变异,其中藏鸡具有极为丰富的遗传变异,杂合度达到0.8220.品种间存在极显著的遗传分化.固原鸡和文昌鸡的遗传距离较近,可聚为一类.藏鸡与这两个品种鸡均遗传距离较远,单独聚为一类;陕西
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基因组密码子使用受多种因素的影响,本试验通过对应分析探讨了若干重要因子对鸡线粒体基因组序列密码子用法的效应。结果指出,在影响最大的第一条向量轴上,基因的位置坐标与该基因的GC3s和GC含量显著相关:r=0.582(p<0.05)和r=0.922(p<0.01);而G+C含量与CAI的相关系数r=-0.823(p<0.01),表明高表达的基因偏爱含A或T的密码子。
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利用8个微卫星位点对吐鲁番、喀什和伊犁斗鸡进行了群体杂合度、多态信息含量、有效等位基因数等的遗传检测,分析了群体间的遗传距离和系统聚类.结果表明:3个地方斗鸡群体在8个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异,吐鲁番斗鸡的平均基因杂合度最高为0.8255;伊犁斗鸡的平均遗传杂合度最低为0.7874.平均多态信息含量也出现了类似的结果,说明吐鲁番斗鸡的遗传多样性最丰富.喀什斗鸡与伊犁斗鸡的遗传距离最远为
A cDNA library from Beijing fatty chicken liver tissue was constructed according to the protocol of SMART TM cDNA library Construction Kit. The qualities of both unamplified and amplified cDNA librari
本研究应用FAO和ISAG准荐的23对微卫星引物,并结合荧光PCR在测序仪上进行片段分析技术,对中国11个地方马品种(12个群体)的和1个英纯血马群体进行了遗传多样性检测.22个微卫星位点在13个马品种中显示出高度多态性.等位基因数、多态信息含量和遗传杂合度等数据表明:中国地方马品种的遗传多样性较为丰富,11个中国马品种的各项遗传多态性指标都高于英国纯血马.在所研究群体中,云南马在期望杂合度(He
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