基于二硫二吡啶功能化磁性微球用于棕榈酰化组的深度覆盖研究

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棕榈酰化作为脂质酰化的一类,能够通过调控蛋白质与膜的锚合和释放在许多生物学过程中扮演着重要的角色。然而,由于棕榈酰化修饰是低丰度的,在质谱分析中选择性差灵敏度低,棕榈酰化修饰的研究规模一直较小。因此,我们发展了一种基于新型的二硫二吡啶功能化的磁性纳米颗粒(Fe3O4/SiO2-SSPy微球)的策略来系统性的鉴定蛋白质的棕榈酰化。由于微球本身固有的磁性特性,使其具有高的比表面积以及丰富的功能化反应基团包裹在磁核表面。而且该功能性微球制备简单,可通过直接在室温水相溶液中将含有巯基的硅烷偶联剂包裹在磁性微球超微粒上得到。利用材料表面的二硫二吡啶与蛋白质巯基间的高效反应,这些纳米颗粒能够直接和自由巯基形成二硫键的方式来捕获含有棕榈酰化修饰的目标物,进而再利用外加磁场的方式方便快速的分离出目标物,有利于对棕榈酰化组学进行高选择地和高灵敏地的深度覆盖分析。所以,我们先利用标准化的棕榈酰化肽段GDFCpalmIQVGR和鼠脑组织来验证我们的方法。最后,我们在经过羟胺(+/-)处理后的小鼠脑组织中鉴定到了1309个潜在的棕榈酰化的蛋白质,这一结果也是迄今为止最大的关于鼠脑棕榈酰化组学的数据集。我们又从中选取了6个候选的潜在棕榈酰化蛋白质利用免疫印迹的方法进一步验证,并且特别发现了GSK-3β在细胞定位和生物学功能上也受到棕榈酰化修饰的调控。
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