管道受限对环形DNA静态结构的影响研究

来源 :2017第十九届中国科协年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wufang78
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  分子细胞内有限空间的限制和分子链自身的闭环结构无疑会对环形DNA的性质产生重大改变,并进一步决定环形DNA参与关键生命过程时的功能。在本课题中,我们采用多粒子碰撞动力学(MPCD)方法,模拟了柔性和半柔性环形DNA分子链受限于管道时的静态结构性质。作为分子链刚性、管道半径以及管壁与DNA作用力类型的函数,我们计算了分子链的持续长度、均方回转半径和取向关联等物理量。研究表明半刚性环形DNA在管道中呈现出双螺旋结构,壁表面的排斥作用会增强这种双螺旋结构,吸附作用会减弱双螺旋结构。
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