高致病性猪蓝耳病病毒ORF5基因和NSP2基因变异分析

来源 :中国畜牧兽医学会动物传染病学分会教学专业委员会第六届第12次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sophia115416
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采用RT-PCR方法对2006~2007年华南地区部分省份的疑似PRRS阳性病料进行克隆和测序,获得13个Nsp2基因的部分序列片段和14个ORF5基因片段。序列分析结果表明,所获得的13个Nsp2基因序列中均有两个区域存在明显缺失,核苷酸的同源性为96.9~99.1%,与中国代表毒株CH-1a、美洲株代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性分别为85.1~86.4%和67.2~68.9%,与疫苗株MLV的同源性在67.6~68.9%之间,而与欧洲株代表株LV的同源性在54.1~55.9%之间;获得的14个ORF5基因序列不存在缺失现象,核苷酸的相似性为同源性为98.8~99.7%,推导编码氨基酸同源性为96.5~99%。与国内毒株相比,核苷酸同源性为85.2~100%,氨基酸同源性为84.6~99%%;与中国代表毒株CH-1a、美洲型代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性分别在94.4~95.2%和86.7~87.9%之间,与疫苗株MLV的同源性在86.4~87.6%之间,而与欧洲型代表株LV的同源性在54.1~55.7%之间,推导编码的氨基酸序列同源性则分别在91.5~93.5%,86.6~88.6%,85.6~87.6%,54.7~56.2%之间。结果表明所获得序列的流行毒株均属于美洲型,进一步分析发现这些毒株可能均起源于同一个毒株,通过猪只运输流通等途径在全国范围流行扩散。
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