【摘 要】
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芬娜金针菇(Flammulina fennae Bas)是一种珍稀食用菌品种,分离自内蒙古乌素图国家森林公园的腐木上。其外形与金针菇(Flammulina velutipes (Curtis) Singer)非常相似,但其
【机 构】
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广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室; 广东粤微食用菌技术有限公司;
【基金项目】
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广东省省级科技计划项目优质高产芬娜金针菇菌种的选育与示范推广2017B020201007
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芬娜金针菇(Flammulina fennae Bas)是一种珍稀食用菌品种,分离自内蒙古乌素图国家森林公园的腐木上。其外形与金针菇(Flammulina velutipes (Curtis) Singer)非常相似,但其食用口感更佳,且出菇整齐度和出菇温度较高,有利于节能减排,因此具有巨大的潜在市场价值。为了进一步了解与开发利用这一重要的食用菌新品种,我们提取了芬娜金针菇的基因组DNA,使用Illumina二代测序平台和PacBio三代测序平台分别对其进行建库测序,下机数据经过质控过滤和联合拼接组装,得到基因组精细图,共得到14个Scaffold,14个Contig,GC含量为49.62%,基因组大小为33.67Mb。同时运用Maker2软件对基因进行预测,通过与5大数据库(NR库,swiss-prot库,Pfam库,COG数据库,GO数据库)比对进行功能注释。针对其钙离子胁迫能力较强的特性,开展了菌丝体生物学实验和转录组测序研究,以期待挖掘与钙离子代谢通道相关的功能基因。全基因组测序以及转录组测序工作的完成有利于芬娜金针菇下一步的DNA分子标记、功能基因筛选及分析,也为进行更深入分子水平研究奠定了重要基础。
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