【摘 要】
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基于对基因组中的末端重复反转录转座子元件广泛搜索和分离,我们分析了八个TRIM家族的特性:十字花科中四个来自甘蓝,四个来自拟南芥(包括以前分离的三个家族)。这些元件包括1
【机 构】
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Department of Plant Science,College of Agriculture and Life Sciences,Seoul National University,San 5
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基于对基因组中的末端重复反转录转座子元件广泛搜索和分离,我们分析了八个TRIM家族的特性:十字花科中四个来自甘蓝,四个来自拟南芥(包括以前分离的三个家族)。这些元件包括100~257bp的末端重复序列(TR)和100~800bp的内部序列。插入位点的多态性可与十字花科的分类和每个元件插入的时间相关联。TRIM展示实验显示十字花科不同的属间和中国大白菜与萝卜F1代存在大量的多态性,这些结果表明TRIM元件可以作为DNA标记来研究芸薹属作物的基因组进化、基因组作图和品种保护。TRIM元件的其它优点包括序列短、优先插入常染色质,而且在拟南芥基因组中发布广泛。
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