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流域生态补偿机制被认为是解决相邻区域、上下游及更高层次上经济发展与生态系统保护问题的有效途径。但是生态补偿标准的计算是一个十分复杂而目前还没有解决的问题。流域生态补偿标准制定中的一个关键问题是流域各方责任的界定。本论文采用两阶段的方法，首先在考虑公平、效率和环境质量的基础上，建立了流域排污权优化分配模型，用通过模型得到的排污权最优分配方案，建立了流域生态补偿中流域各方责任界定模型。这一研究成果为流域生态补偿标准的估算模型建立提供了基础。