侵染广东黄瓜的瓜类褪绿黄化病毒分子检测及基因组序列分析

来源 :中国植物病理学会2021年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:m116730647
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瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)属于长线形病毒科(Closteroviridae)毛线病毒属(Crinivirus)成员,主要由烟粉虱(Bemisia tabaci)以半持久性方式传播,是一种双分体正单链RNA病毒,包括RNA1和RNA2两条链。CCYV病害症状主要表现叶片褪绿、黄化,早期叶脉仍然保持绿色,后期整株叶片变黄。该病毒于2004年首次在日本甜瓜上被发现,2010年起已在我国台湾、山东、河南、北京等多地有报道,可见该病毒扩散速度快,已成为影响瓜类作物正常生产的重要病毒。2020年调查发现广东省广州市、湛江市、廉江市的黄瓜植株叶片明显黄化,且植株上存在大量烟粉虱,由此推测这些黄瓜植株可能被CCYV侵染。并从每调查点随机采集5份典型症状的黄瓜病样,合计15份疑似病样,利用扩增CCYV的热激蛋白70的特异引物对病样进行RT-PCR检测,能从12份病样中扩增出单一预期大小目的条带证实黄瓜病样中确实存在CCYV,且检出率80%。进一步采用分段扩增、克隆测序方法,共获得GDNS2、GDLJ4、GDXW1共3个广东分离物全基因组序列,3个分离物大小和基因组结构一致,RNA1全长大小为8 607 bp,包含4个ORF,分别编码ORF1a、RdRp、P6、P22蛋白,5’UTR和3’UTR的长度分别为73 nt和250 nt,所获的3个广东分离物相似性为99.73%~99.81%,与已报道的CCYV其他分离物的全基因组序列相似性为99.55%~99.90%,其中与台湾分离物(登录号:JN641883.1)的相似性最高,分别为99.87%、99.90%、99.86%。RNA2全长大小8 041bp,包含8个ORF,分别编码p4.9、Hsp70 h、p6、p59、p9、CP、CPm、p26蛋白,5’UTR和3’UTR的长度分别为1 034 nt和221 nt,所获的3个广东分离物相似性为99.73%~99.80%,与已报道的CCYV其他分离物的全基因组序列相似性为99.53%~99.91%,其中GDNS2、GDXW1分离物与台湾分离物(登录号:JF502222)的相似性最高,为99.91%和99.83%,GDLJ4分离物与山东分离物(登录号:MH819191)相似性最高,为99.91%。本文首次明确CCYV 3个广东黄瓜分离物的分子特征,为开展该病毒种群遗传特征、序列变异与进化等研究提供了素材。
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