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全社会科技经费筹集额上海一直处于四直辖市之第二,但增速最慢;上海科技经费筹集额中政府资金的比重在20％以上,但比北京低近20个百分点。上海科技经费支出额一直处于四直辖市第二的位置，但是增幅最低;上海科技经费支出额占地方GDP的比重2007年达到4.34％，远低于北京的8.82％。上海地方财政科技拨款增长迅猛，地方财政科技拨款占地方财政支出的比重逐年上升，2007年居全国第二。上海研究与发展(R&D)经费持续增加，R&D/GDP的比重2007年达到2.5％，但仍远远低于北京的比重。上海的R&D主要以试验发展为主，基础研究较为薄弱;上海的R&D集中在企业，比重超过七成;R&D经费中来自政府的资金比重远远低于北京。