Strategies for de novo assembling complex genomes

来源 :The Sixth International Conference of the Peanut Research Co | 被引量 : 0次 | 上传用户:mylovesm
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Obtaining a reference genome is the first step for better understanding an organism in whole genome scale.The continue reducing cost for sequencing and improvement of assembling tools enable to initiate large scale genome project, such as 10K vertebrate genome and 5K insect genome project, as well as many plant genome projects.Yet, the huge genome size, polyploidy, high level of repetitive sequences, and heterozygosis are the main challenges for genome de novo assembly.Here I will talk about the potential strategies for de novo assembling complex genome and show some cases we have done by using these strategies.
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