【摘 要】
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目的:STAT3是一种信号转导与转录激活蛋白,在表达ALK融合基因的间变大细胞淋巴瘤(Anaplastic Large Cell Lymphoma,ALCL)中发挥着重要的生物学功能;然而ALK融合型非小细胞肺癌(Non Small Cell LungCancer,NSCLC)中STAT3的功能尚无定论.本研究通过构建STAT3相互作用蛋白(protein-protein interactions
【机 构】
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广东省肺癌研究所 广东省人民医院广东省医学科学院 510080广州
【出 处】
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中国抗癌学会肺癌专业委员会第十二届全国肺癌学术大会
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目的:STAT3是一种信号转导与转录激活蛋白,在表达ALK融合基因的间变大细胞淋巴瘤(Anaplastic Large Cell Lymphoma,ALCL)中发挥着重要的生物学功能;然而ALK融合型非小细胞肺癌(Non Small Cell LungCancer,NSCLC)中STAT3的功能尚无定论.本研究通过构建STAT3相互作用蛋白(protein-protein interactionsPPIs)网络,将与其相关的分子进行生物学过程、信号转导通路与疾病三个层次的富集分析,探讨其在ALK融合型NSCLC中的生物学特点。
方法:钓取HPRD数据库中与STAT3作用的所有蛋白,利用cytoscape(v2.7)软件以节点(Node)为2构建PPIs网络。使用在线工具DAVID将与STAT3相互作用蛋白的编码基因进行基因本体注释(Gene Ontology,GO);参考KEGG数据库,使用GSEA(Gene Set EnrichmentAnalysis GSEA)(http://www.broadinstitute.org/gsealindexjsp)进行信号通路富集分析;并采用自主开发文献挖掘工具,将整个PPIs网络的所有分子纳入疾病特异性富集分析。多重比较结果采用Bonferroni法进行P值校正;p<0.05认为具有统计学意义。
结果:STAT3在PPIs网络中处于核心位置;ALK作为上游分子,可通过调节与STAT3存在相互作用关系113个分子来控制肿瘤细胞的生物学行为。将这些分子进行GO注释,得到36个有意义的GO分类匹配,涉及“通过磷酸化进行信号转导”、“膜受体酪氨酸激酶信号通路”、“正性细胞增殖调节”、“细胞活化”、“抗凋亡”等诸多与肿瘤发生、进展相关的生物学过程;将参与PPIs网络构建的分子进行的KEGG通路的富集分析,得到23条有意义的信号通路,涉及“Jak-STAT signaling pathway”“Regulation of Androgenreceptor activity”“EGF Signaling Pathway”“PDGFSignaling Pathway”“MAPK signaling pathway”等肺癌中高度活化的通路;同时,将这些分子进行各种疾病的富集分析后发现,该PPIs网络主要与4种疾病显著相关,分别为,"Lung Neoplasms"" Prostatic Neoplasms"" C-reactiveprotein""Ovarian Neoplasms",其中肺癌的相关度最高(p=0.0001355 )。
结论:STAT3与NSCLC的发生、发展密切相关;应用生物信息学方法预测,ALK融合型NSCLC通过对STAT3的调节,控制着肿瘤诸多关键生物学行为:引起癌细胞多条关键信号转导通路的异常活化。具体调控机制有待后续分子生物学试验的进一步验证。
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