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行业特色型高校建立协同创新战略联盟，是高校、科研院所和企业多方共赢、整体提升可持续发展能力的新途径。良好的运行机制，有助于高校在推进协同创新过程中，充分发挥特色学科群结构合理、行业背景深厚影响力出色、综合实力强的优势。高校参与协同创新必须建立有组织创新、协同管理、科学评价体系、资源共享、利益协调分配等协同机制，保障协同创新联盟健康持续发展。