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炭疽病是辣椒上的重要病害，世界各地均有发生报道，给辣椒生产带来严重损失.中国是世界上最主要的辣椒生产国，每年因炭疽病造成的减产可达30％到40％.Colletotrichumtruncatum是引起辣椒炭疽病的主要病原菌之一，其寄主广泛，可侵染400多种植物，目前尚未见中国地区该病原菌的群体遗传多样性方面的研究报道，国外虽有部分研究报道，但由于所采用的RAPD等分子标记方法的准确性和重复性均较差，未能很好的反映该病原菌的群体情况，因此有必要选用可靠的分子标记方法对该病原菌的群体遗传多样性进行研究.本研究选用SSR分子标记的方法，对采自中国多个辣椒产区的C.truncatum的群体遗传多样性进行了研究，所获得的结果可以为该病害的田间防治及抗病品种的选育提供参考.