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杨梅果实成熟后期(即转色期到完熟期)在颜色、口感等方面发生显著变化，然而现有研究大多停留在生理分析层面，序列信息的匮乏严重限制了分子机制的探讨。本研究中应用高通量RNA—Seq技术，结合运用生物信息学手段，探究果实成熟品质变化的相关分子机制，综合Ipath整体代谢网络及色泽、糖、酸品质代谢途径UniGenes表达量情况，结合生理指标变化，发现花青苷代谢途径基因均呈上调模式，与成熟后期颜色变化相一致；蔗糖磷酸合成酶(SPS)、谷氨酸脱羧酶(GAD)可能在果实糖分积累和有机酸降解过程中起重要作用。本研究为果实品质调控提供理论依据。