野生二粒小麦叶绿体基因RNA编辑位点的预测与鉴定分析

来源 :第六届全国小麦基因组学及分子育种大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaotaowang33
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  RNA编辑是高等植物叶绿体基因转录后表达调控的一种重要方式。本研究通过生物信息学预测结合分子克隆的方法,对野生二粒小麦叶绿体基因的RNA编辑位点进行了预测和鉴定。生物信息学预测共发现了分布于15个基因上的35个编辑位点,均为C到U的转换,其中ndhB包含的编辑位点数量最多,达9个;在此基础上,随机选取5个基因对其编辑位点进行了实验验证,结果共鉴定了18个C-U的编辑;进一步对编辑后编码蛋白的二级结构和跨膜结构域进行了预测,发现编辑后所有基因均发生了二级结构的改变,但只有ndhB的跨膜结构域也发生了改变;最后,将确定的野生二粒小麦叶绿体基因RNA编辑位点与其他几种禾本科作物的RNA编辑位点进行比较,共发现17个编辑位点在禾本科物种间具有保守性。
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