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目的：探讨荧光多重PCR片段分析微卫星不稳定的实验方法.方法：应用ABI-3100型测序仪对54例肿瘤和36例正常人进行多片段的多重PCR微卫星不稳定性(MSI)片段分析,采用GeneMapper软件进行数据分析和统计.结果：44例散发性肠癌肿瘤组织中MSI的检出率为27.3％(12/44),MSS为72.7(32/44);4例前列腺癌未检出MSI,3例子宫内膜异型增生有1例为MSI-H,2例胃腺癌未检出MSI,1例慢性萎缩性胃炎伴异型增生表现为MSI-H.中国人五个微卫星位点在正常人中的长度及杂合率与NCBI的参考数据有明显区别.结论：多重PCR可高通量诊断MSI,在MSI分析中需注意片段长度的种族特点.应用荧光多重PCR基因测序仪和GeneMapper分析软件进行微卫星不稳定检测效率高,结果可靠.