为了解海南岛中华蜜蜂Apis cerana cerana的遗传多样性和遗传结构,本研究应用10个微卫星DNA标记对海南岛11个样点的627只样本和岛外2个样点中华蜜蜂样本进行了分析。海南岛中华蜜蜂在10个微卫星DNA位点上多态性较好,每个位点检测到等位基因5~17个;不同样点平均等位基因数为4.5~7.0,平均杂合度为0.59~0.65。海南岛中华蜜蜂在9位点上以单种或两种等位基因为主,其比例占各样点50%以上,在Ap085位点共享8种等位基因。岛内-岛外之间的遗传分化系数Fst范围0.07~0.13;海南岛文昌和屯昌样点分别同岛内其他样点间Fst范围0.06~0.12,大于岛内其他样点间Fst。本研究结果表明,海南岛中华蜜蜂遗传多样性较高;海南岛中华蜜蜂同琼州海峡对岸的广东从化、广西南宁样点中华蜜蜂发生了较明显的遗传分化,岛内多数多数样间中华蜜蜂分化较小,仅文昌、屯昌样点分别出现了中等遗传分化。