以春夏季节我国海域主要红藻物种为研究对象，以叶绿体基因组中的rbcL基因和核基因组中ITS为目标序列，获得红藻门6个目、15个科、24个属、44个物种的rbcL基因和ITS序列.6个目分别是红毛菜目、江蓠目、仙菜目、杉藻目、石花菜目、珊瑚藻目、；15个科分别为红毛菜科、江蓠科、松节藻科、海膜科、石花菜科、绒线藻科、仙菜科、海头红科、育叶藻科、珊瑚藻科、沙菜科、杉藻科、茎刺藻科、内枝藻科、红翎菜科；24个属分别为紫菜属、红毛菜属、江蓠属、软骨藻属、多管藻属、蜈蚣藻属、卡帖藻属、石花菜属、异管藻属、仙菜属、鸭毛藻属、海头红属、拟伊藻属、珊瑚藻属、沙菜属、凝菜属、管形藻属、纵胞藻属、海柏属、软刺藻属、茎刺藻属、海萝属、叉节藻属、凹顶藻属；44个物种分别为条斑紫菜、坛紫菜、半叶紫菜、红毛菜、海南江蓠、真江蓠、龙须菜、脆江蓠、细基江蓠、长心卡帕藻、带型蜈蚣藻、亚洲蜈蚣藻、繁枝蜈蚣藻、舌状蜈蚣藻、鲂生蜈蚣藻、江氏蜈蚣藻、复瓦蜈蚣藻、细枝软骨藻、丛托多管藻、多管藻、美丽异管藻、日本异管藻、石花菜、小石花菜、异形石花菜、细毛石花菜、柔质仙菜、纵胞藻、鸭毛藻、海头红、扇形拟伊藻、小珊瑚藻、珊瑚藻、带形叉节藻、凝菜、长枝沙菜、小沙菜、密毛沙菜、广东管形藻、海柏、中间软刺藻、茎刺藻、海萝、凹顶藻.这些红藻物种分子信息的获得，对认识我国海洋红藻物种的生物多样性，构建我国海洋红藻数字化信息平台有重要的意义.