【摘 要】
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2014/2015冬季在东亚地区新现一种GⅡ.17型诺如病毒流行株,并在中国引发了一轮新的流行高峰.本文对广州地区首株分离株的基因组特征进行了系统研究.首先通过"4+1+1"策略扩增
【机 构】
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广东省微生物研究所;华南应用微生物国家重点实验室;广东省菌种保藏与应用重点实验室;广东省微生物应用新技术公共实验室,广东广州510070
【出 处】
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2016第五届中国食品安全高峰论坛
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2014/2015冬季在东亚地区新现一种GⅡ.17型诺如病毒流行株,并在中国引发了一轮新的流行高峰.本文对广州地区首株分离株的基因组特征进行了系统研究.首先通过"4+1+1"策略扩增并拼接获得广州株GZ2014-L311的全基因组序列,毒株基因组全长为7495bp,编码3个开放阅读框,大小分别为5109bp、1623bp及780bp.多重比对及系统发育结果显示,GZ2014-L311与不同GⅡ型诺如病毒代表株的基因组同源性为63.5％-99.6％,其中与KP998539|CUHK-NS-463株同源性最高.此外,根据GⅡ.17型病毒衣壳蛋白构建系统发育树,结果表明广州株属于最新出现的GⅡ.17-Kawasaki流行株;而根据不同GⅡ.17型变异株衣壳蛋白的比对结果发现,GⅡ.17型病毒衣壳蛋白在进化过程中共存在87处变异位点,而其中21处是伴随新流行株而产生的.本文对首例GⅡ.17广州株GZ2014-L311进行了系统的基因组序列分析,诺如病毒基因组的积累不但有助于加深对病毒流行规律的认识,同时也为病毒进化机理研究提供了重要的参考数据.
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