An Efficient and Versatile Tool for Automatic Fragment-Based Design

来源 :中国化学会第十届全国化学生物学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:joshua5201314
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  In structure-based drug design,automated de novo design methods are helpful tools for lead discovery as well as lead optimization.In a previous study(J.Chem.Inf.Model.,2011,51,1474–1491),we reported a new de novo design method,namely Automatic Tailoring and Transplanting(AutoT&T).It overcomes some intrinsic problems in conventional fragment-based build-up methods.
其他文献
生物硫醇包括半胱氨酸(Cys),高半胱氨酸(Hcy)和谷胱甘肽(GSH),然而细胞内的Cys 与Hcy 浓度较低,不足GSH 的10%.GSH 的浓度在1-10 mM 之间,通过还原型GSH 与氧化型GSSG 维持细胞内的氧化还原平衡.其浓度的异常往往会影响细胞的正常功能,如生长、代谢、应激、免疫功能等.
依赖于经典的碱基互补配对原则,传统的DNA 自组装技术能够实现各种各样纳米结构的组装,并在纳米光子学、纳米制造、合成生物学等领域发挥重要作用。然而,由于核酸酶降解、对高离子强度的依赖等原因,这类DNA 纳米结构在生理条件下的稳定性差,并大大限制了其生物医学应用。
Geometrical shape of nanoparticles plays an important role in cellular internalization.However,the applicability in tumor selective therapeutics is still scarcely reported.
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由富鸟嘌呤核酸序列形成的G-四链体是目前最为引人关注的一类核酸特殊二级结构.G-四链体/富G 单链之间,G-四链体/其他二级结构之间的动态转换在众多生命事件中起着关键调控作用.因此,G-四链体被认为是继双螺旋之后又一个重要的功能性结构.然而,基因组转录组中存在众多核酸二级结构,同时也存在众多富G 序列,特别是由不同富G 序列所形成的G-四链体,其结构相似,但变化规律、功能与相互作用对象却大不相同,
Autophagy is a dynamic catabolic process initiated by oxidative stress and proceeding with the formation of autophagosomes and their subsequent fusion with lysosomes.
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The hydroxyl radical(· OH)has been considered to be one of the most reactive oxygen species produced in biological systems,which can cause DNA,protein,and lipid oxidation.
微小核糖核酸(microRNA,miRNA)是细胞内源性的一类非编码小RNA 分子,可在转录后水平调控基因的表达,参与了众多生理以及病理过程,对细胞内miRNA 所参与的生物学过程的解析或者调控对于生物医学则具有重要的意义。
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