【摘 要】
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目的：利用RNA-Seq技术对500mmol·L-1NaCl胁迫处理的盐穗木进行转录组测序,鉴定盐穗木盐胁迫应答相关基因,从转录组水平揭示盐穗木适应盐胁迫环境的分子机制.方法：提取正常
【机 构】
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新疆大学生命科学与技术学院,新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐830046
【出 处】
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全国农业生物化学与分子生物学第十六届学术研讨会
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目的：利用RNA-Seq技术对500mmol·L-1NaCl胁迫处理的盐穗木进行转录组测序,鉴定盐穗木盐胁迫应答相关基因,从转录组水平揭示盐穗木适应盐胁迫环境的分子机制.方法：提取正常生长和500 mmol·L-1NaCl胁迫处理15d的盐穗木同化枝总RNA,以Illumina Hiseq 4000平台进行RNA-Seq测序分析.利用NGS QC Tookit v2.3.3去除低质量的reads后进行denovo拼接,应用DESeq软件对基因进行差异表达分析,对差异基因进行GO和KEGG代谢通路富集分析,选择10个DEGs进行实时荧光定量PCR验证RNA-Seq结果的可靠性.结果：经过500 mmol·L-1NaCl胁迫处理15d,共检测到7088个差异表达基因,其中上调表达基因2753个,下调表达基因4335个.GO富集分析显示差异表达基因广泛涉及翻译、防御反应、响应寒冷、响应氧化胁迫和响应脱水等(图1).
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