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水生呼肠孤病毒隶属于呼肠孤病毒科水生呼肠孤病毒属，可感染多种淡水或海水水生动物并造成不同程度危害，严重影响了水产养殖业健康发展。水生呼肠孤病毒基因组为分11个节段的双链RNA，推测编码12种结构多肽。本文综述了近年来水生呼肠孤病毒基因组序列测定及其应用的研究进展，可进一步了解水生呼肠孤病毒基因组的多样性、推测其编码蛋白的功能，也为检测方法的建立、基因工程疫苗的研制以及抗病毒研究提供借鉴和参考。